More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1281 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  59.85 
 
 
678 aa  842    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1281  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
699 aa  1439    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 
732 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.01 
 
 
732 aa  273  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  31.43 
 
 
792 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 
710 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 
770 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  29.76 
 
 
710 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
719 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
734 aa  250  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  29.4 
 
 
727 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 
707 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 
757 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 
694 aa  244  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  28.41 
 
 
709 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.7 
 
 
745 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 
734 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  29.87 
 
 
736 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  29.33 
 
 
680 aa  236  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.89 
 
 
715 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  28.65 
 
 
695 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 
689 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 
712 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
749 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  30.8 
 
 
656 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 
706 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 
742 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 
706 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 
742 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  29.93 
 
 
755 aa  225  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 
689 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.4 
 
 
850 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 
700 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 
707 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
698 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 
753 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.01 
 
 
751 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 
815 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  28.72 
 
 
705 aa  211  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 
708 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 
747 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 
821 aa  204  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.74 
 
 
709 aa  203  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
828 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 
708 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 
696 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4373  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 
751 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 
701 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 
828 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 
828 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.42 
 
 
701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.14 
 
 
859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 
713 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27.99 
 
 
837 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 
711 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 
689 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 
771 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
719 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.28 
 
 
703 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 
799 aa  195  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 
706 aa  194  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
720 aa  194  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  28.2 
 
 
771 aa  193  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 
797 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 
820 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 
794 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.91 
 
 
703 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 
705 aa  192  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 
713 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
703 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 
724 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  27.26 
 
 
715 aa  191  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  26.91 
 
 
794 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 
766 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
735 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 
692 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 
737 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  28.18 
 
 
736 aa  188  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
712 aa  188  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 
724 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 
701 aa  188  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  29 
 
 
705 aa  187  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  27.82 
 
 
740 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  26.54 
 
 
718 aa  187  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  28.24 
 
 
719 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  28.84 
 
 
696 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  28.39 
 
 
753 aa  187  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.16 
 
 
769 aa  186  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.17 
 
 
708 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 
778 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 
740 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 
755 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  28.7 
 
 
696 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 
731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.03 
 
 
696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  27.81 
 
 
696 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  27.62 
 
 
698 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  28.84 
 
 
696 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 
710 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
708 aa  185  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>