More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1253 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
303 aa  630  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  69.44 
 
 
302 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  65.45 
 
 
302 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  64.9 
 
 
306 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  61.26 
 
 
298 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  54.15 
 
 
306 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  58.16 
 
 
302 aa  354  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  56.61 
 
 
299 aa  348  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  52.98 
 
 
302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  50.66 
 
 
310 aa  333  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  51.33 
 
 
303 aa  317  2e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  50.51 
 
 
300 aa  311  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  52 
 
 
304 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  52 
 
 
304 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  52 
 
 
304 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  39.14 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  40.57 
 
 
324 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  39.73 
 
 
289 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.53 
 
 
461 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  60.98 
 
 
118 aa  153  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.52 
 
 
484 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.18 
 
 
482 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  33.56 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.14 
 
 
363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.39 
 
 
411 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  28.98 
 
 
307 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  43.55 
 
 
304 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.24 
 
 
286 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
291 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
301 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  30.85 
 
 
330 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 
301 aa  101  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
294 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
296 aa  99  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
296 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.39 
 
 
475 aa  97.4  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.53 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  41.23 
 
 
329 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
299 aa  93.6  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
320 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
302 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3187  Alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
301 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.33 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
290 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.33 
 
 
361 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  25.75 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  28.31 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
298 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
321 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  34.53 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
290 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.22 
 
 
369 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  25.18 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  27.78 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3658  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.58 
 
 
639 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  34.51 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.33 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  27.97 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  27.7 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  36.29 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02800  haloalkane dehalogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01700)  31.09 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.417921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  25.94 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  36.29 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  27.62 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  25.38 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>