228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1238 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
156 aa  327  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  91.67 
 
 
156 aa  305  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 
161 aa  152  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  44.6 
 
 
161 aa  135  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  43.26 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  39.5 
 
 
143 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
142 aa  85.5  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  37.62 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  26.75 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  28.67 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  37.62 
 
 
130 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  28.28 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  31.58 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  31.62 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.63 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  35.54 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  27.46 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.51 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
164 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  28.17 
 
 
150 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  31.97 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  26.97 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  31.03 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  31.03 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  26.95 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  31.03 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  28.79 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  31.03 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  31.03 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  31.03 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  27.64 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.47 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  28.45 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  30.97 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.79 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  29.06 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  25.2 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  31.4 
 
 
134 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  29.84 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  27.73 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>