More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1223 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  73.48 
 
 
223 aa  342  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 
231 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  45.92 
 
 
231 aa  198  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 
230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.83 
 
 
226 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 
244 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  46.55 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 
230 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  44.59 
 
 
246 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  41.45 
 
 
226 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  45.02 
 
 
229 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  41.03 
 
 
226 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00938  transcriptional regulatory protein CpxR  43.44 
 
 
236 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000268904  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
228 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  45.73 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  47.01 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  42.24 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.77 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.77 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.3 
 
 
229 aa  181  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 
235 aa  181  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  44.64 
 
 
247 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  41.99 
 
 
232 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  45.49 
 
 
228 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 
227 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  46.72 
 
 
225 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 
228 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  42.19 
 
 
233 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 
227 aa  174  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 
227 aa  174  9e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  47.83 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.96 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.16 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  47.16 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  43.35 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  46.35 
 
 
227 aa  172  5e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  42.5 
 
 
245 aa  172  5e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  47.39 
 
 
241 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  47.16 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  44.02 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  42.5 
 
 
245 aa  171  6.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  42.19 
 
 
253 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 
225 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.53 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
230 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.53 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.53 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.53 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.53 
 
 
232 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  45.06 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 
238 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 
262 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 
225 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.79 
 
 
237 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.83 
 
 
239 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3846  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
229 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.225052  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  45.19 
 
 
232 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  46.32 
 
 
228 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 
226 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 
226 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  42.49 
 
 
234 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 
230 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 
225 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  44.1 
 
 
227 aa  168  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 
235 aa  167  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
226 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 
251 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  44.02 
 
 
245 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.88 
 
 
275 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  43.83 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3589  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.92 
 
 
225 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110518  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.92 
 
 
231 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 
226 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  43.1 
 
 
232 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5579  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.24 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00126537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  42.11 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  44.35 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 
227 aa  164  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>