More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1192 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  100 
 
 		 274 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  96.72 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  84.01 
 
 		 271 aa  484  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000275406  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  60.75 
 
 		 270 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  59.93 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  59.93 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  59.93 
 
 		 268 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  59.7 
 
 		 270 aa  335  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  58.58 
 
 		 268 aa  334  7.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  59.55 
 
 		 268 aa  334  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.906333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  59.33 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  59.7 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000202985  hitchhiker  0.0000000000656111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  59.62 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  59.7 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000050651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  59.7 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000224276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  59.7 
 
 		 270 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000137718  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  56.34 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  59.33 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  59.62 
 
 		 270 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  58.58 
 
 		 270 aa  331  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  58.87 
 
 		 270 aa  331  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  58.96 
 
 		 270 aa  330  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  58.21 
 
 		 269 aa  329  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000598983  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  58.96 
 
 		 268 aa  329  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000103891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  58.87 
 
 		 270 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  60.15 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  59.62 
 
 		 270 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  58.36 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  57.84 
 
 		 268 aa  326  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000170984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  58.49 
 
 		 270 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  59.25 
 
 		 270 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  58.43 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  58.43 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  58.43 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  58.43 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  58.43 
 
 		 268 aa  325  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  58.58 
 
 		 269 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  58.58 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  55.72 
 
 		 289 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  58.74 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  58.87 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.294828 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  57.68 
 
 		 272 aa  322  6e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  56.88 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  55.56 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  58.87 
 
 		 270 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  57.09 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  56.72 
 
 		 268 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  56.88 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  56.34 
 
 		 268 aa  318  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  56.88 
 
 		 268 aa  318  7.999999999999999e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  57.46 
 
 		 268 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  56.34 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  54.81 
 
 		 273 aa  316  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  56.72 
 
 		 268 aa  316  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  56.13 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000518305  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  56.13 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  56.13 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000370761  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  57.3 
 
 		 267 aa  315  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  56.67 
 
 		 271 aa  314  8e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  56.93 
 
 		 268 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  56.34 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  56.09 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  54.24 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  52.04 
 
 		 270 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  55.76 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  36.43 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  35.51 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.04 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  37.04 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  35.69 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  36.07 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4910  exodeoxyribonuclease III  36.9 
 
 		 283 aa  158  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.38033  decreased coverage  0.000445359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.36 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  34.77 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  36.47 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1085  exodeoxyribonuclease III  34.93 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.647883  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1911  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  36.09 
 
 		 264 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  35.71 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  33.7 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2668  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  34.06 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  35.07 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  35.85 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  36.88 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  34.8 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  34.19 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5986  exodeoxyribonuclease III Xth  34.8 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.294616 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0065  exodeoxyribonuclease III Xth  36.8 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2221  exodeoxyribonuclease III  35.06 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  35.09 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  36.19 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>