207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1156 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  96.93 
 
 		 550 aa  1033    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  100 
 
 		 553 aa  1101    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  48.5 
 
 		 550 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  43.5 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  41.92 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 465 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 463 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  41.31 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 472 aa  360  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  74.71 
 
 		 630 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 471 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 471 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  41.78 
 
 		 462 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  40.5 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 475 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 461 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  41.88 
 
 		 447 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  40.32 
 
 		 515 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  40.24 
 
 		 516 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  40.12 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  39.72 
 
 		 515 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  40.52 
 
 		 519 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  40.24 
 
 		 516 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  37.68 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  39.8 
 
 		 515 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 576 aa  282  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 478 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 465 aa  257  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 468 aa  256  9e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 443 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  30.71 
 
 		 450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  30.06 
 
 		 447 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  46.12 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  30.97 
 
 		 457 aa  200  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  30.17 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  47.8 
 
 		 466 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 441 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  43.5 
 
 		 415 aa  187  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  29.53 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  43.69 
 
 		 417 aa  183  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  45.15 
 
 		 449 aa  183  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 444 aa  181  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3019  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 523 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.649834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  47.21 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  48.15 
 
 		 594 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  51.43 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 547 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  47.22 
 
 		 594 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 456 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 509 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1565 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  39.74 
 
 		 1565 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  42.23 
 
 		 495 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  26.91 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  41.75 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  28.38 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 451 aa  158  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  28.75 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  46.56 
 
 		 598 aa  157  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  44.95 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  40.38 
 
 		 492 aa  151  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  26.51 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  36.86 
 
 		 462 aa  147  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  37.5 
 
 		 489 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  39.71 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  39.71 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  39.71 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.9 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  40.76 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.48 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 491 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>