More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1140 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1140  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
552 aa  1145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.578898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1815  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:[2Fe-2S]-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  37.82 
 
 
484 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522719  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.55 
 
 
479 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.03 
 
 
487 aa  334  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3809  xanthine dehydrogenase  39.08 
 
 
484 aa  332  9e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3660  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  37.36 
 
 
484 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807153  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  36.76 
 
 
494 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  38.29 
 
 
496 aa  329  9e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3604  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.33 
 
 
484 aa  328  2e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.703198  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.89 
 
 
492 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44710  xanthine dehydrogenase  38.53 
 
 
484 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0199275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4278  xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  35.42 
 
 
484 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1590  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.79 
 
 
484 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.597851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1797  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  36.25 
 
 
484 aa  322  1e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.014868  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4257  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.2 
 
 
481 aa  321  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  36.65 
 
 
493 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5910  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.94 
 
 
537 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  36.38 
 
 
480 aa  317  3e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  35.87 
 
 
496 aa  317  4e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3842  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.61 
 
 
484 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.977655  normal  0.775119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  35.96 
 
 
499 aa  316  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  36.21 
 
 
492 aa  313  6e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3320  xanthine dehydrogenase  36.48 
 
 
490 aa  313  7e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.48 
 
 
504 aa  312  8e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  36.65 
 
 
543 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.16 
 
 
492 aa  310  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3907  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.72 
 
 
542 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.36 
 
 
488 aa  310  6e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4499  xanthine dehydrogenase small subunit  35.42 
 
 
496 aa  308  2e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.999061  normal  0.0980927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  36.62 
 
 
515 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2300  xanthine dehydrogenase small subunit  34.57 
 
 
476 aa  300  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289203  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.57 
 
 
497 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.83 
 
 
512 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  33.76 
 
 
500 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.62 
 
 
480 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2246  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.71 
 
 
504 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1922  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.53 
 
 
504 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.501378 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.74 
 
 
488 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.89 
 
 
493 aa  293  7e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.71 
 
 
498 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  37.17 
 
 
484 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2422  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.88 
 
 
505 aa  287  3e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  33.33 
 
 
528 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.89 
 
 
523 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.97 
 
 
526 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.15 
 
 
528 aa  280  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.89 
 
 
520 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.13 
 
 
516 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.88 
 
 
507 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.46 
 
 
527 aa  276  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.6 
 
 
485 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0799  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  34.95 
 
 
515 aa  275  1e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  36.51 
 
 
485 aa  275  2e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.41 
 
 
485 aa  275  2e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  35.36 
 
 
501 aa  272  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3886  putative xanthine dehydrogenase  32.78 
 
 
507 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  33.46 
 
 
516 aa  270  3e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0793  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.23 
 
 
507 aa  270  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.229921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.79 
 
 
530 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0499  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.14 
 
 
467 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.258857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.82 
 
 
507 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.01 
 
 
506 aa  266  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0937  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.06 
 
 
486 aa  266  9e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.45 
 
 
507 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2042  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  33.64 
 
 
505 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0871  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  33.64 
 
 
505 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222869  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3215  xanthine dehydrogenase  33.64 
 
 
505 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.413066  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3199  xanthine dehydrogenase family protein, iron-sulfur-binding/FAD-binding subunit  33.64 
 
 
505 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188115  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3160  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.46 
 
 
505 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2705  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  33.64 
 
 
505 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1905  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  33.64 
 
 
505 aa  257  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1408  xanthine dehydrogenase, N-terminal subunit  33.33 
 
 
592 aa  253  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5002  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.64 
 
 
512 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  34.06 
 
 
483 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.9 
 
 
461 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  33.27 
 
 
467 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1155  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.21 
 
 
518 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1481  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.22 
 
 
571 aa  237  5e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0612404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.66 
 
 
468 aa  237  5e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.66 
 
 
467 aa  236  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.37 
 
 
514 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.09 
 
 
490 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  28.9 
 
 
470 aa  200  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05613  Xanthine dehydrogenase (EC 1.17.1.4)(Purine hydroxylase I) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12553]  28.92 
 
 
1363 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  0.0769199 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15968  predicted protein  27.44 
 
 
1387 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.59 
 
 
450 aa  150  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.27 
 
 
305 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.75 
 
 
284 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.21 
 
 
288 aa  113  8e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  28.21 
 
 
288 aa  113  8e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  26.02 
 
 
280 aa  112  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  27.24 
 
 
276 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2647  (2Fe-2S)-binding domain protein  34.97 
 
 
162 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3075  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  33.91 
 
 
160 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09178  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 
1350 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5356  (2Fe-2S)-binding domain protein  37.35 
 
 
162 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1739  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  31.96 
 
 
164 aa  99.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3678  carbon-monoxide dehydrogenase small subunit  35.44 
 
 
165 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5356  putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit  33.71 
 
 
211 aa  98.2  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0891145  normal  0.130334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1782  (2Fe-2S)-binding  38.61 
 
 
165 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.381616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>