More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1125 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  84.94 
 
 
720 aa  1276    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.917383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  100 
 
 
716 aa  1492    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1574  DNA primase  59.78 
 
 
705 aa  837    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0270687  normal  0.0108391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  46.96 
 
 
663 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  46.65 
 
 
664 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  44.55 
 
 
660 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.37 
 
 
652 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  44.41 
 
 
655 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  44.41 
 
 
663 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  43.93 
 
 
660 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  43.93 
 
 
660 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.84 
 
 
651 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  43.3 
 
 
660 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  42.86 
 
 
584 aa  251  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  43.45 
 
 
638 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  40.91 
 
 
581 aa  250  7e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  42.39 
 
 
582 aa  248  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  42.53 
 
 
584 aa  249  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  40.72 
 
 
581 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  42.53 
 
 
582 aa  248  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  42.53 
 
 
582 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  42.53 
 
 
582 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  41.56 
 
 
581 aa  246  9e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  42.11 
 
 
588 aa  245  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  43.32 
 
 
676 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  43.28 
 
 
645 aa  243  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  42.14 
 
 
577 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  42.14 
 
 
578 aa  243  7.999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  41.23 
 
 
584 aa  243  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  40.91 
 
 
584 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  42.81 
 
 
652 aa  239  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  41.04 
 
 
666 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  42.03 
 
 
574 aa  237  7e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  42.81 
 
 
571 aa  236  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  41.7 
 
 
576 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  41.1 
 
 
660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  41.91 
 
 
586 aa  234  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  43.49 
 
 
595 aa  234  5e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  41.47 
 
 
598 aa  234  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  40.06 
 
 
585 aa  233  8.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  41.12 
 
 
614 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1407  DNA primase  43.19 
 
 
674 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  39.83 
 
 
658 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  44.44 
 
 
653 aa  232  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  43.19 
 
 
653 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  39.81 
 
 
575 aa  231  4e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  44.19 
 
 
677 aa  231  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  40.13 
 
 
583 aa  229  9e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  43.01 
 
 
578 aa  229  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  40.07 
 
 
584 aa  229  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.5 
 
 
579 aa  229  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  40.07 
 
 
617 aa  229  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  40.32 
 
 
581 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  40.32 
 
 
581 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  40.32 
 
 
581 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.5 
 
 
601 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  40.32 
 
 
581 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  40.32 
 
 
581 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40 
 
 
656 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  38.78 
 
 
577 aa  228  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  38.78 
 
 
577 aa  228  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  41.97 
 
 
613 aa  226  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  42.91 
 
 
576 aa  226  8e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  39.18 
 
 
574 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  39.18 
 
 
574 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  39.18 
 
 
574 aa  226  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  43.28 
 
 
659 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  33.64 
 
 
573 aa  225  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  38.24 
 
 
574 aa  226  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  38.56 
 
 
574 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  40.82 
 
 
586 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  37.2 
 
 
574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  37.2 
 
 
574 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  36.9 
 
 
574 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  36.61 
 
 
574 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.49 
 
 
592 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  43.64 
 
 
622 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.08 
 
 
609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  36.9 
 
 
574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  43.9 
 
 
603 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  43.9 
 
 
603 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  42.61 
 
 
630 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  42.96 
 
 
623 aa  221  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  41.42 
 
 
576 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  33.65 
 
 
575 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  42.96 
 
 
636 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.51 
 
 
582 aa  218  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  39.41 
 
 
583 aa  216  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  41.81 
 
 
613 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  37.34 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.2 
 
 
553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  37.2 
 
 
572 aa  215  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  44.13 
 
 
625 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>