162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1037 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  811    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  58.76 
 
 
496 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 
377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  30.97 
 
 
378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  36 
 
 
375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 
780 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
395 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  32.1 
 
 
383 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  31.49 
 
 
395 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  29.75 
 
 
386 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  30.27 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  30 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
381 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
382 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  29.19 
 
 
379 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  31.12 
 
 
378 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  31.1 
 
 
381 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 
384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
392 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 
384 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  29.59 
 
 
382 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.13 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  31.62 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  30.66 
 
 
381 aa  139  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 
382 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.27 
 
 
293 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 
367 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  29.71 
 
 
390 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  28.65 
 
 
395 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  27.53 
 
 
387 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  28.11 
 
 
362 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  25.07 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  27.11 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  23.45 
 
 
391 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  25 
 
 
377 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  25.08 
 
 
383 aa  94.7  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  25 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  23.99 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.08 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  23.99 
 
 
372 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  26.88 
 
 
371 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  23.94 
 
 
379 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24.25 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  22.85 
 
 
405 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  22.99 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  22.39 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  23.39 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  30.67 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  22.05 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  26.26 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  23.5 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.1 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  27.27 
 
 
491 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  22.91 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.32 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  23.26 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.59 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  23.78 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.36 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 
373 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.41 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 
397 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  20 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 
365 aa  61.2  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  22.64 
 
 
382 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  23.77 
 
 
395 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  21.95 
 
 
376 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 
367 aa  59.7  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 
378 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  21.96 
 
 
365 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.88 
 
 
373 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  25.15 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  21.2 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  22.42 
 
 
366 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 
368 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 
373 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.05 
 
 
384 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>