46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0976 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 
435 aa  894    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  58.31 
 
 
419 aa  488  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  50.62 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  51.6 
 
 
384 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  43.69 
 
 
409 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  45 
 
 
406 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  42.31 
 
 
408 aa  345  8.999999999999999e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  42.27 
 
 
399 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  39.95 
 
 
401 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  40.57 
 
 
401 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  40.89 
 
 
401 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  39.43 
 
 
382 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  39.41 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  38.57 
 
 
403 aa  305  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  40.05 
 
 
380 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  38.27 
 
 
390 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  40.89 
 
 
381 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 
404 aa  279  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  41.04 
 
 
388 aa  272  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  40.52 
 
 
388 aa  266  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  40.26 
 
 
388 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  40.52 
 
 
388 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  40.52 
 
 
388 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  40.52 
 
 
388 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  40.52 
 
 
388 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  40.52 
 
 
388 aa  265  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  40 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  36.75 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  35.92 
 
 
373 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  33.65 
 
 
429 aa  229  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  34.15 
 
 
439 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  32.3 
 
 
409 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  33.25 
 
 
403 aa  212  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  32.28 
 
 
410 aa  206  5e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  32.76 
 
 
429 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  34.47 
 
 
424 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  24.1 
 
 
377 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  26.7 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  22.38 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
380 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  23.51 
 
 
360 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3337  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.58 
 
 
394 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.21 
 
 
360 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 
381 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>