21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0953 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  100 
 
 
688 aa  1402    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  35.7 
 
 
730 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  34.29 
 
 
739 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.59 
 
 
667 aa  319  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  28.51 
 
 
666 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  29.45 
 
 
816 aa  186  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  40.62 
 
 
1787 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  21.5 
 
 
677 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  24.52 
 
 
706 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  23.76 
 
 
706 aa  67  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  21.58 
 
 
520 aa  60.8  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  29.89 
 
 
685 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  20.82 
 
 
708 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  19.4 
 
 
657 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  18.99 
 
 
550 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  18.99 
 
 
550 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  18.99 
 
 
550 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.76 
 
 
696 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  33.85 
 
 
589 aa  45.8  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  30.33 
 
 
261 aa  44.3  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  40 
 
 
367 aa  44.3  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>