174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0951 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 419 aa  864    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  65.76 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.29 
 
 		 413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.04 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  51.4 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  31.53 
 
 		 419 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  31.85 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  28.82 
 
 		 387 aa  143  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.54 
 
 		 442 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.25 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  35.4 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  30.62 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  28.37 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  29 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  25.27 
 
 		 435 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  32.28 
 
 		 388 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  29.32 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  29.8 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  25.9 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  24.06 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.88 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  37.5 
 
 		 175 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  27.27 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  32.18 
 
 		 562 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  24.6 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.29 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.94 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.94 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.72 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  26.98 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  34.01 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.83 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  21.29 
 
 		 415 aa  93.6  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  30.49 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  22.61 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  22.61 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3768  restriction modification system DNA specificity subunit  20.88 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.42 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.19 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  30.86 
 
 		 351 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  26.18 
 
 		 442 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  22.9 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.09 
 
 		 205 aa  87  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.06 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  24.89 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  27.65 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  26.81 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  26.34 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  23 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  25.45 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  29.08 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.83 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.61 
 
 		 462 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  29.55 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.13 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.05 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  22.22 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  23.15 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  26.8 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  26.29 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  21.57 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  20 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.7 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  26.23 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  29.41 
 
 		 1343 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  23.8 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  26.67 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.07 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  28.5 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.04 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  22.9 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  25.16 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  27.18 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  25.77 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  27.96 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  26.24 
 
 		 429 aa  67  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  25 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  25.09 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.54 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  29.71 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  28.28 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  21.18 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12774  type I restriction/modification system specificity determinant hsdS  23.68 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  26.71 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  20.25 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  22.46 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  22.77 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  19.96 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.42 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  27.33 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.33 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  25.99 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  25.79 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  27.12 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.85 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  26.45 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>