More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0764 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  100 
 
 
582 aa  1179    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  36.83 
 
 
589 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  36.67 
 
 
589 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  36.83 
 
 
589 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  36.83 
 
 
589 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  36.83 
 
 
589 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  36.67 
 
 
589 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  36.67 
 
 
589 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  37.25 
 
 
589 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  36.74 
 
 
589 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  36.97 
 
 
591 aa  362  9e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  39.47 
 
 
522 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  34.36 
 
 
584 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 
584 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 
587 aa  319  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  34.91 
 
 
591 aa  317  5e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  32.54 
 
 
576 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  34.49 
 
 
572 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  33.39 
 
 
564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.53 
 
 
568 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  32.53 
 
 
579 aa  300  4e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  32.82 
 
 
576 aa  296  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.84 
 
 
567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  33.39 
 
 
581 aa  270  4e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.82 
 
 
568 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 
578 aa  259  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  28.64 
 
 
556 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  28.4 
 
 
558 aa  242  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  28.62 
 
 
556 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 
580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  29.95 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  29.95 
 
 
565 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  29.73 
 
 
559 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  29.73 
 
 
559 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 
559 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  29.73 
 
 
559 aa  232  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  29.73 
 
 
559 aa  232  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 
566 aa  231  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  29.56 
 
 
559 aa  231  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.08 
 
 
572 aa  230  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  28.91 
 
 
572 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  29.03 
 
 
565 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 
557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 
557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.29 
 
 
557 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  30.12 
 
 
557 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 
556 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  28.75 
 
 
576 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  31.7 
 
 
603 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.12 
 
 
557 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.12 
 
 
557 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.12 
 
 
581 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  29.96 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  29.2 
 
 
566 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  29.68 
 
 
581 aa  220  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  27.09 
 
 
569 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  28.35 
 
 
565 aa  219  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  28.16 
 
 
565 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  28.55 
 
 
558 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  27.55 
 
 
558 aa  217  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  27.66 
 
 
565 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  29.24 
 
 
560 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  27.1 
 
 
577 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  28.47 
 
 
560 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  29.68 
 
 
568 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  28.33 
 
 
560 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  27.99 
 
 
565 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  30.02 
 
 
563 aa  213  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  28.92 
 
 
560 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 
565 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  28.86 
 
 
565 aa  210  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 
565 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 
438 aa  210  6e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 
565 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  27.63 
 
 
560 aa  210  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  28.71 
 
 
560 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  27.3 
 
 
561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  28.79 
 
 
559 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  29.64 
 
 
558 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
561 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.91 
 
 
455 aa  200  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  30.48 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  26.85 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  27.03 
 
 
561 aa  198  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.44 
 
 
450 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 
560 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  28.14 
 
 
560 aa  197  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  26.92 
 
 
563 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 
446 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  33.51 
 
 
431 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>