More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0677 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  99.53 
 
 
211 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  81.52 
 
 
211 aa  364  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  55.5 
 
 
212 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  55.5 
 
 
212 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  53.33 
 
 
214 aa  243  2e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  55.02 
 
 
212 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  52.86 
 
 
222 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  51.43 
 
 
214 aa  238  6e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  51.43 
 
 
214 aa  238  6e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
214 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  52.2 
 
 
209 aa  234  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  51.47 
 
 
208 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  49.07 
 
 
219 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  51.66 
 
 
214 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  46.19 
 
 
219 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  44.98 
 
 
214 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  45.45 
 
 
227 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.89156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  44.02 
 
 
214 aa  208  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  46.19 
 
 
219 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  43.54 
 
 
218 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  44.55 
 
 
214 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.06395e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3672  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
181 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  hitchhiker  2.90511e-07 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  43.06 
 
 
214 aa  200  1e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  44.29 
 
 
218 aa  199  2e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  46.23 
 
 
220 aa  199  2e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.57663e-07  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.84326e-05  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.0455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.44757e-08  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.21601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.24814e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  42.38 
 
 
214 aa  198  4e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  5.64902e-06 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.06228e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  43.13 
 
 
220 aa  197  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  1.6111e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  43.06 
 
 
218 aa  197  1e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.26498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  43.06 
 
 
218 aa  197  1e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  42.58 
 
 
218 aa  197  1e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  43.06 
 
 
218 aa  197  1e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2182e-06  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  44.02 
 
 
218 aa  196  2e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  44.5 
 
 
218 aa  196  2e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  2.38763e-15 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  42.58 
 
 
218 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  41.15 
 
 
214 aa  195  4e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  42.11 
 
 
229 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  42.58 
 
 
218 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  41.63 
 
 
214 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.60452e-09  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.46753e-07  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.88339e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  7.50596e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  42.11 
 
 
214 aa  191  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  40.67 
 
 
226 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
214 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  41.15 
 
 
214 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  41.63 
 
 
214 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  41.71 
 
 
216 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3242  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
213 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000371761  hitchhiker  0.000468813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003098  BarA-associated response regulator UvrY  43.17 
 
 
188 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  2.68807e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  40.48 
 
 
215 aa  177  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  45.69 
 
 
198 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
216 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  39.52 
 
 
214 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2089  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
220 aa  173  1e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.954326  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
214 aa  174  1e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  38.39 
 
 
220 aa  173  2e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1526  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 
215 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.88337  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01869  hypothetical protein  41.53 
 
 
191 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.30184e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
216 aa  166  3e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  37.8 
 
 
216 aa  165  4e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 
215 aa  164  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0726  response regulator  37.62 
 
 
211 aa  161  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  41.43 
 
 
209 aa  161  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
213 aa  160  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  37.14 
 
 
211 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 
212 aa  157  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 
210 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
210 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  38.76 
 
 
217 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 
217 aa  157  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
210 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  39.52 
 
 
210 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
236 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
210 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1804  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 
212 aa  154  7e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.023063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 
210 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
210 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
215 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01879  response regulator  41.25 
 
 
169 aa  151  6e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  6.14586e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
211 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
214 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
214 aa  147  1e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  38.46 
 
 
210 aa  145  4e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 
218 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 
218 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>