30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0533 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  87.17 
 
 
207 aa  320  6e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  60.4 
 
 
156 aa  150  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  27.87 
 
 
211 aa  77  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  30.86 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  34.03 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  51.72 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  28.76 
 
 
152 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  32.85 
 
 
159 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  28.3 
 
 
154 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  29.53 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  27.39 
 
 
143 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  37.14 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  29.22 
 
 
164 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  36.62 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  27.04 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  57.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  37.31 
 
 
153 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  32.95 
 
 
166 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  27.04 
 
 
160 aa  57.8  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  31.97 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  29.01 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  24.85 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  37.7 
 
 
263 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  27.67 
 
 
156 aa  52.4  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  36.07 
 
 
249 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  31.51 
 
 
272 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  43.9 
 
 
253 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>