16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0270 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  100 
 
 		 425 aa  842    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0421  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3437  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533693  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 773 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0144  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0149  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0420  O-antigen polymerase  42.19 
 
 		 478 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000329147  normal  0.0182315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  32.5 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.5 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  37.29 
 
 		 437 aa  43.5  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 735 aa  43.1  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  32.81 
 
 		 456 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  30.68 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>