25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0253 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0227  hypothetical protein  77.94 
 
 
514 aa  741    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0395217  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0253  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1021    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.13037  normal  0.68079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2030  hypothetical protein  26.84 
 
 
542 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127968  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0003  hypothetical protein  24.53 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00559809  unclonable  0.0000000111615 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3669  putative 5-methylcytosine restriction system component  24.89 
 
 
436 aa  67  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2661  hypothetical protein  21.15 
 
 
429 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0154  hypothetical protein  21.54 
 
 
445 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.899736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2471  5-methylcytosine restriction system component- like protein  21.96 
 
 
428 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.248512 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7439  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like  21.68 
 
 
445 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0135  hypothetical protein  21.54 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0584774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3724  hypothetical protein  22.97 
 
 
418 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1240  hypothetical protein  21 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0689849  hitchhiker  0.000177876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1654  hypothetical protein  21.94 
 
 
424 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4726  hypothetical protein  18.72 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4531  hypothetical protein  28.89 
 
 
267 aa  53.5  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.814257  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1862  hypothetical protein  21.79 
 
 
431 aa  53.5  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3330  hypothetical protein  24.55 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3309  IQ calmodulin-binding- domain protein  20.87 
 
 
426 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2911  hypothetical protein  22.89 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1591  hypothetical protein  21.03 
 
 
429 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1981  hypothetical protein  20.12 
 
 
428 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51853  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1703  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  22.71 
 
 
421 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3671  hypothetical protein  21.59 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0176  hypothetical protein  21.29 
 
 
288 aa  44.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1386  McrBC 5-methylcytosine restriction system component-like protein  30.14 
 
 
411 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>