50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0204 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  100 
 
 
389 aa  811    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  48.47 
 
 
413 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  29.54 
 
 
358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
383 aa  113  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 
330 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 
328 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 
313 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 
351 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
339 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  26.41 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 
328 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  27.18 
 
 
843 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  26 
 
 
328 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  25.73 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  24.8 
 
 
328 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  24.53 
 
 
328 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  23.96 
 
 
329 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  25.4 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  25.13 
 
 
327 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  25.46 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  24.11 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.86 
 
 
328 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
333 aa  87.4  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 
328 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  24.4 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  23.64 
 
 
355 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  23.95 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 
360 aa  77  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 
329 aa  75.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  22.31 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  26.11 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  24.18 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  24.43 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  22.76 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  23.53 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  23.01 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  24.41 
 
 
344 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  23.03 
 
 
338 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48060  predicted protein  29.03 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  21.9 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  23.28 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  22.74 
 
 
344 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  29.17 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>