More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0199 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  72.37 
 
 
312 aa  438  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  36.36 
 
 
294 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  36.71 
 
 
335 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  33.56 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 
310 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 
310 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  36.33 
 
 
298 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  36.69 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  36.21 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  36.27 
 
 
302 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  36.69 
 
 
310 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  36.69 
 
 
310 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  36.33 
 
 
310 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  36.33 
 
 
310 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  33.91 
 
 
300 aa  158  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  36.33 
 
 
310 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  35.49 
 
 
310 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 
308 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  35.49 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  35.49 
 
 
308 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  35.92 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  34.27 
 
 
298 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  35.27 
 
 
308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  35.27 
 
 
308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  35.27 
 
 
308 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  36.33 
 
 
310 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  35.47 
 
 
324 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  34.93 
 
 
322 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  35.96 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  34.36 
 
 
308 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  33.57 
 
 
298 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.31 
 
 
324 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  36.4 
 
 
301 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  33.81 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  33.09 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  30.96 
 
 
297 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  33.45 
 
 
295 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  30.2 
 
 
303 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
319 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.3 
 
 
311 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  26.8 
 
 
310 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  29.22 
 
 
302 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  27.72 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.62 
 
 
307 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  27.87 
 
 
311 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  28.87 
 
 
319 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.33 
 
 
301 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 
303 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  28.23 
 
 
296 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  28.14 
 
 
302 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  30.43 
 
 
306 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  27.88 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  27.02 
 
 
317 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  26.99 
 
 
311 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  27.86 
 
 
304 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  30.43 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  25.96 
 
 
291 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2596  hypothetical protein  27.36 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  27.04 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  25.96 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  28.67 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  25.59 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  26.64 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 
305 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
307 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 
304 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  29.03 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  26.6 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  28.3 
 
 
290 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.92 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0594  hypothetical protein  26.04 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  25.78 
 
 
301 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  27.21 
 
 
321 aa  86.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.84 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.11 
 
 
289 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  27.76 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  25.5 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  26.5 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  26.04 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  27.34 
 
 
379 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  29.23 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  30.55 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.62 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  27.84 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  23.71 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>