More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0136 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2245  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.93 
 
 		 798 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.659597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.73 
 
 		 812 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.24 
 
 		 861 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.67 
 
 		 784 aa  654    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0584  RNA binding S1 domain protein  47.28 
 
 		 769 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.717148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  46.82 
 
 		 779 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2991  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.72 
 
 		 772 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.940851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.12 
 
 		 804 aa  647    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4965  putative transcription accessory protein  45.16 
 
 		 796 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.71 
 
 		 813 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0904  tex protein, putative  45.32 
 
 		 767 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2332  RNA binding S1 domain protein  47.08 
 
 		 838 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.430037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  48.12 
 
 		 773 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00795  S1 RNA binding domain protein  47.35 
 
 		 786 aa  639    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0660252  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.86 
 
 		 780 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4130  RNA binding S1 domain protein  44.6 
 
 		 787 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.05 
 
 		 774 aa  659    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  46.73 
 
 		 784 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2122  RNA-binding S1 domain-containing protein  72.51 
 
 		 849 aa  1230    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161735  normal  0.0955174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  47.97 
 
 		 772 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0127  hypothetical protein  97.02 
 
 		 840 aa  1648    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.294313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  46.32 
 
 		 772 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  48.04 
 
 		 777 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  47.09 
 
 		 802 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  47.36 
 
 		 795 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  48.72 
 
 		 821 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  47 
 
 		 765 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  48.03 
 
 		 774 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  47.8 
 
 		 777 aa  661    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  46.93 
 
 		 774 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4015  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.8 
 
 		 803 aa  649    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  47.09 
 
 		 778 aa  666    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0137  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.6 
 
 		 787 aa  641    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.233986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1303  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.29 
 
 		 772 aa  647    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.035241  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  47.88 
 
 		 790 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  47.23 
 
 		 775 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1368  transcription-related protein  45.03 
 
 		 772 aa  640    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  47.3 
 
 		 772 aa  682    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2410  RNA binding S1 domain protein  44.89 
 
 		 795 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.367587  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  47.99 
 
 		 781 aa  656    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  48.05 
 
 		 782 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  47.4 
 
 		 788 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3912  RNA binding S1 domain protein  46.64 
 
 		 777 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0136  RNA binding S1  100 
 
 		 840 aa  1714    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.43679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  47.84 
 
 		 787 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  46.93 
 
 		 815 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.51 
 
 		 774 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  45.25 
 
 		 775 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0317  RNA binding S1  46.39 
 
 		 772 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.499934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4202  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.72 
 
 		 787 aa  642    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0326222  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2039  RNA binding S1 domain protein  47.69 
 
 		 795 aa  665    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.883528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  48.93 
 
 		 779 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.11 
 
 		 787 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  47.48 
 
 		 767 aa  663    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0539  RNA binding S1 domain protein  46.01 
 
 		 769 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.500263  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1472  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.07 
 
 		 782 aa  647    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  47.46 
 
 		 788 aa  676    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.71 
 
 		 774 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  47.61 
 
 		 779 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  49.19 
 
 		 773 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.18 
 
 		 802 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  48.26 
 
 		 773 aa  647    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.93 
 
 		 774 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.97 
 
 		 774 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4104  Tex-like protein protein-like protein  47.15 
 
 		 777 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4334  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.91 
 
 		 787 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.515985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3508  hypothetical protein  45.01 
 
 		 778 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.631069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.06 
 
 		 815 aa  647    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  46.65 
 
 		 773 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  48.98 
 
 		 770 aa  650    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.59 
 
 		 774 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  46.78 
 
 		 766 aa  666    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0813  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.84 
 
 		 771 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179863  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0772  RNA binding S1 domain protein  49.25 
 
 		 771 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  48.72 
 
 		 774 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.51 
 
 		 774 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4627  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.08 
 
 		 777 aa  634  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  44.09 
 
 		 782 aa  635  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2166  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.76 
 
 		 780 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.897398  normal  0.40683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.47 
 
 		 776 aa  635  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  44.95 
 
 		 793 aa  630  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03259  predicted transcriptional accessory protein  46.79 
 
 		 772 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0306  RNA binding S1 domain protein  46.79 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3604  protein yhgF  46.79 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1032  S1 RNA-binding domain-containing protein  48.97 
 
 		 735 aa  629  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.013008  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2205  RNA-binding S1 domain-containing protein  47.35 
 
 		 766 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234468  normal  0.570218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4713  putative transcriptional accessory protein  46.92 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3786  putative transcriptional accessory protein  46.79 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3688  putative transcriptional accessory protein  46.66 
 
 		 773 aa  631  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.913461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0243  RNA binding S1  46.4 
 
 		 799 aa  630  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03211  hypothetical protein  46.79 
 
 		 773 aa  632  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  46.95 
 
 		 775 aa  632  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3881  protein yhgF  46.79 
 
 		 773 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0462  RNA binding S1 domain protein  46.69 
 
 		 769 aa  632  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0306  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.66 
 
 		 773 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0742204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>