More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0096 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0096  histidine kinase internal region  100 
 
 
383 aa  779    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  27.68 
 
 
372 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  30.3 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.39 
 
 
364 aa  93.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 
367 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  26.07 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  33.57 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  25.08 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  30.81 
 
 
341 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  25.25 
 
 
343 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  24.76 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  30.46 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  25.89 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  25.65 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  30.88 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  29.17 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  29.17 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  27.46 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  28.49 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  33.59 
 
 
831 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  28.57 
 
 
366 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  31.33 
 
 
358 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  26.52 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  24.91 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  41.77 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  23.18 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  31.08 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  28.23 
 
 
576 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  29.71 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  30.07 
 
 
576 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  24.36 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 
561 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
565 aa  73.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  28.25 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  28.64 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  35.34 
 
 
577 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  27.34 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  32.84 
 
 
565 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  31.97 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 
563 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  30.22 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 
562 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  32.12 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  26.92 
 
 
576 aa  70.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  41.25 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  28.57 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 
586 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  26.59 
 
 
1018 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 
572 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  41.46 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  39.42 
 
 
564 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 
1016 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  32.14 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  31.33 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  31.33 
 
 
355 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  21.31 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  24.16 
 
 
491 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  21.31 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  25.7 
 
 
556 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1837  signal transduction histidine kinase, LytS  33.57 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.230047  normal  0.631331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  32.21 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  25.58 
 
 
556 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  26.29 
 
 
440 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  25.13 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  25.13 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  30.71 
 
 
568 aa  67  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  23.68 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5336  signal transduction histidine kinase, LytS  26.29 
 
 
347 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  30.71 
 
 
589 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  32.81 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  28.95 
 
 
581 aa  66.6  0.0000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  27.06 
 
 
642 aa  66.2  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  24.87 
 
 
465 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  24.06 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  26.2 
 
 
558 aa  65.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
579 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  29.86 
 
 
407 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  29.87 
 
 
368 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.54 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  27.15 
 
 
557 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>