More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0059 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  100 
 
 		 86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  90.7 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  63.54 
 
 		 97 aa  120  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  53.95 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  53.95 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  53.95 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  53.95 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  56.58 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  56.94 
 
 		 78 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  55.26 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  55.26 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  55.41 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  45.88 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  52.63 
 
 		 81 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  53.95 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  51.16 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  53.75 
 
 		 81 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  52.78 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  52.78 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  50.63 
 
 		 80 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  60 
 
 		 81 aa  86.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  56.16 
 
 		 81 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  50.68 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  52.78 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  54.17 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  52.05 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  54.17 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  47.56 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  50.68 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  52.63 
 
 		 81 aa  83.6  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  50.68 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  54.93 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  44.71 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  47.62 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  55.71 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  51.25 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  52.56 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  55.71 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  51.43 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  51.39 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  52.86 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  55.71 
 
 		 80 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  51.25 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  46.84 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  46.25 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  48.68 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  55.71 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  55.71 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  55.71 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  48.1 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  50.67 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  48.19 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  50 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  46.75 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  45.9 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.06 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  39.44 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  38.89 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.94 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  37.1 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  29.11 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  36.62 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.96 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 831 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  30.38 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  37.14 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  40.32 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  38.57 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  36.62 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  36 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  38.46 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  27.85 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  30.67 
 
 		 75 aa  57  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  57  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  30.67 
 
 		 75 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>