151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0053 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0045  hypothetical protein  94.23 
 
 		 416 aa  791    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.402941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0053  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 428 aa  867    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0054  permease YjgP/YjgQ family protein  56.62 
 
 		 494 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  31.08 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  31.44 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  31.43 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.42 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  31.43 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.43 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  29.8 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  30.49 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  29.08 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  31.32 
 
 		 373 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  30.49 
 
 		 372 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  29.69 
 
 		 375 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  31.38 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  30.43 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.85 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.13 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  25.81 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.5 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  23.57 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.81 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  26.72 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  25.66 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  23.33 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  25.73 
 
 		 388 aa  104  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.98 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  25.52 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.74 
 
 		 369 aa  100  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  27.23 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  27.23 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.23 
 
 		 364 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 		 371 aa  99.8  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  25.46 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 		 372 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 363 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 364 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 364 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  25.39 
 
 		 357 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  25.79 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  23.84 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  24.11 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  23.84 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.86 
 
 		 370 aa  90.5  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 371 aa  88.6  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  22.92 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 370 aa  87  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 366 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  23.47 
 
 		 373 aa  86.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  25.58 
 
 		 366 aa  86.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  25.58 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  24.35 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  21.12 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.48 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3719  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  25.19 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  25.19 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  25.19 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  25.19 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  25.19 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  23.53 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  23.22 
 
 		 356 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  22.13 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  22.13 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  22.19 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  21.52 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  24.63 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  23.1 
 
 		 361 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>