68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0050 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0050  putative DNA polymerase III, chi subunit  100 
 
 		 151 aa  313  4e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.443992 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0042  DNA polymerase III, chi subunit  84.21 
 
 		 152 aa  266  1e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0052  DNA polymerase III chi subunit, HolC  39.16 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02658  DNA polymerase III subunit chi  31.58 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2116  DNA polymerase III chi subunit HolC  24.67 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2098  DNA polymerase III, chi subunit, putative  27.46 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14460  DNA polymerase III subunit chi  28.77 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1281  DNA polymerase III subunit chi  28.77 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0288  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.52 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  25.5 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  27.4 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1371  DNA polymerase III, chi subunit  25.48 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.217758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0682  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.17 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.237318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0624  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161546  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0112  DNA polymerase III subunit chi  27.08 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0096  DNA polymerase III subunit chi  27.08 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2117  DNA polymerase III subunit chi  28.15 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3083  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.63 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0979  DNA polymerase III subunit chi  26.03 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1017  DNA polymerase III subunit chi  26.03 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2141  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.7 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3721  DNA polymerase III subunit chi  25.97 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1232  DNA polymerase III chi subunit HolC  23.13 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  26.97 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0745  DNA polymerase III chi subunit, HolC  28.38 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.753041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3649  DNA polymerase III subunit chi  25.33 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.303922 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3738  DNA-directed DNA polymerase  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1941  DNA polymerase III, chi subunit  23.36 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206934  normal  0.0768542 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0387  DNA polymerase III subunit chi  25.83 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04089  hypothetical protein  25.49 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.218538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3558  DNA polymerase III subunit chi  25.83 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.967018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5780  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04125  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.171112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4515  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000205378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4830  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0579073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4822  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00375029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0985  DNA polymerase III subunit chi  25.34 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4739  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00452125  normal  0.589357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3753  DNA polymerase III subunit chi  25.49 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1749  DNA polymerase III chi subunit, HolC  24.49 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0525  DNA polymerase III subunit chi  24.83 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0286  DNA polymerase III, chi subunit  24.84 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0557  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.53 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0829  DNA polymerase III subunit chi  25 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.525292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4238  DNA polymerase III subunit chi  26.21 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0535  DNA polymerase III subunit chi  23.97 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.815318 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2921  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.17 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.171955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0443  DNA polymerase III subunit chi  25.17 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  30 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4862  DNA polymerase III subunit chi  25.32 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0611412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2741  DNA polymerase III chi subunit, HolC  29.23 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.464581  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  25 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4762  DNA polymerase III subunit chi  25.32 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0153251  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4732  DNA polymerase III subunit chi  25.32 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8643  normal  0.315665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4881  DNA polymerase III subunit chi  25.32 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.983564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4825  DNA polymerase III subunit chi  25.32 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2409  DNA polymerase III subunit chi  27.41 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446453  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2168  DNA polymerase III subunit chi  26.87 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0875446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3563  DNA polymerase III chi subunit, HolC  22.82 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1090  DNA polymerase III subunit chi  25.17 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1726  DNA polymerase III chi subunit HolC  24.09 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3161  DNA polymerase III chi subunit, HolC  23.29 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  27.63 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1922  DNA polymerase III chi subunit, HolC  25.55 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.127132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3680  DNA polymerase III subunit chi  25.61 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3544  DNA polymerase III subunit chi  25.61 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0256768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4046  DNA polymerase III subunit chi  25.61 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0924  DNA polymerase III chi subunit, HolC  23.7 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>