44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0028 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  373  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  73.6 
 
 
180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  42.22 
 
 
190 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  41.34 
 
 
176 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  41.21 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  39.33 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  37.78 
 
 
175 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  35.59 
 
 
173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  36.67 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  39.36 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  32.21 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  29.53 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  33.56 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  34.4 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  32.79 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  35.78 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30.72 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  29.58 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  29.51 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  33.75 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  28.1 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  27.81 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  29.37 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  28.1 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  29.7 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  28.71 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  27.7 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  27.45 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  27.34 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  32.22 
 
 
183 aa  60.8  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  25.93 
 
 
181 aa  58.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  28.57 
 
 
175 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  30.77 
 
 
215 aa  52.4  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  30.51 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>