12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0025 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0025  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  822    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000632784  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2441  hypothetical protein  41.01 
 
 
393 aa  302  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242342  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0485  hypothetical protein  25.42 
 
 
405 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000025501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0298  hypothetical protein  24.58 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00012102  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0247  hypothetical protein  22.97 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241657  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0711  hypothetical protein  21.31 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1119  ATPase  22.82 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.907161  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2817  ATPase  26.99 
 
 
360 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1868  hypothetical protein  21.16 
 
 
376 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349095  normal  0.0567455 
 
 
-
 
NC_002950  PG2078  hypothetical protein  24.84 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.75 
 
 
1868 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4867  hypothetical protein  21.8 
 
 
376 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  0.601837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>