More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0022 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0031  MATE efflux family protein  79.84 
 
 		 503 aa  771    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0022  MATE efflux family protein  100 
 
 		 524 aa  1040    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00967763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1044  MATE efflux family protein  54.81 
 
 		 494 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  47.94 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  48.88 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1091  MATE efflux family protein  48.6 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.719825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  49.13 
 
 		 486 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3884  MATE efflux family protein  46.64 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  45.4 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2639  MATE efflux family protein  50.54 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05514  hypothetical protein  40.67 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.957983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  36.42 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  35.46 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  35.46 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  35.46 
 
 		 469 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  34.81 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  35.02 
 
 		 469 aa  279  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  35.02 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  35.02 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  35.54 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  35.02 
 
 		 469 aa  277  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2862  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.83664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3177  MATE efflux family protein  35.98 
 
 		 469 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.186099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1159  MATE efflux family protein  35.23 
 
 		 478 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.666411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1839  MATE efflux family protein  33.69 
 
 		 480 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3541  multi anti extrusion protein MatE  34.62 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2889  MATE efflux family protein  35.78 
 
 		 471 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03157  hypothetical protein  36.7 
 
 		 455 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.367645 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2347  MATE efflux family protein  35.84 
 
 		 476 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4169  MATE efflux family protein  35.55 
 
 		 455 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0187  MATE efflux family protein  35.32 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4281  MATE efflux family protein  35.55 
 
 		 455 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.711709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0162  multi anti extrusion protein MatE  33.33 
 
 		 449 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1972  putative multi anti extrusion protein (MatE)  33.71 
 
 		 458 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  0.887527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0316  putative multi anti extrusion protein (MatE)  34.03 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  31.01 
 
 		 448 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2869  MATE efflux family protein  33.1 
 
 		 472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0768419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  25.81 
 
 		 460 aa  177  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  27.89 
 
 		 448 aa  161  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  26.99 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  28.97 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  27.4 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  26.62 
 
 		 486 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1055  MATE efflux family protein  26.73 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000467502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  25.19 
 
 		 443 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1641  Na+ driven multidrug antiporter, N-terminus  38.39 
 
 		 238 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0465  MATE efflux family protein  33.7 
 
 		 500 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1642  Na+ driven multidrug antiporter, C-terminus  33.94 
 
 		 270 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  29.26 
 
 		 442 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  26.32 
 
 		 477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  27.87 
 
 		 538 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.93 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3276  MATE efflux family protein  26.53 
 
 		 457 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000381455  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0451  MATE efflux family protein  25.91 
 
 		 446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000226029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  30.31 
 
 		 453 aa  137  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  25.9 
 
 		 554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1810  MATE efflux family protein  24.38 
 
 		 446 aa  134  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.108169  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  25.36 
 
 		 485 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  26.55 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  24.8 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  25.52 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3692  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000025823  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  24.44 
 
 		 475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  27 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  26.16 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  26.34 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3385  MATE efflux family protein  25.76 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  26.75 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  24.76 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  23.38 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  26.3 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0512  Na+-driven multidrug efflux pump  28.24 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.08405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3019  MATE efflux family protein  27.66 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  26.27 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2841  MATE efflux family protein  25.44 
 
 		 468 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000678206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0217  MATE efflux family protein  25.34 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 445 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  23.36 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  24.53 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30280  putative efflux protein, MATE family  26.68 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0173  Na+-driven multidrug efflux pump  28.74 
 
 		 446 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000291986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1842  MATE efflux family protein  28.99 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000407528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.27 
 
 		 453 aa  117  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0086  MATE efflux family protein  27.59 
 
 		 522 aa  117  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1597  Na+-driven multidrug efflux pump  30.28 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0508805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  22.22 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  23.72 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  27.42 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  23.84 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  25.21 
 
 		 525 aa  114  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  22.38 
 
 		 498 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  23.81 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  23.98 
 
 		 454 aa  110  8.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1371  MATE efflux family protein  27.58 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>