More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0014 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0014  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
551 aa  1141    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2133  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  46.86 
 
 
526 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1559  FAD dependent oxidoreductase  48.89 
 
 
523 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
546 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1345  FAD dependent oxidoreductase  44.85 
 
 
532 aa  429  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
527 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0359  FAD dependent oxidoreductase  43.49 
 
 
526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000963274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24950  putative FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.25 
 
 
461 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0595  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
551 aa  334  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.492849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4358  FAD dependent oxidoreductase  39.8 
 
 
523 aa  327  5e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 
528 aa  249  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  32.91 
 
 
533 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
554 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.74 
 
 
566 aa  242  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  32.83 
 
 
529 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
582 aa  235  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 
525 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.35 
 
 
591 aa  232  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  32.1 
 
 
519 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
567 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
537 aa  226  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.16 
 
 
525 aa  225  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.23 
 
 
585 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
557 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
524 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
560 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.45 
 
 
530 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 
560 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 
537 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.37 
 
 
560 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 
534 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 
536 aa  216  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.19 
 
 
560 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 
546 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.27 
 
 
557 aa  214  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.01 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.01 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.01 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 
516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.01 
 
 
560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
603 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.01 
 
 
560 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
546 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  32.01 
 
 
560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 
550 aa  213  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 
556 aa  213  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
532 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  31.47 
 
 
560 aa  210  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 
543 aa  211  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 
548 aa  210  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
532 aa  210  5e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0056  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
564 aa  209  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 
574 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
557 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
579 aa  207  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 
545 aa  207  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  31.88 
 
 
573 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.67 
 
 
573 aa  207  4e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
569 aa  207  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
582 aa  206  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 
542 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  30.21 
 
 
543 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
560 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4361  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
557 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
518 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.75 
 
 
554 aa  203  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.71 
 
 
551 aa  203  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 
600 aa  203  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  30.87 
 
 
539 aa  202  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.18 
 
 
583 aa  202  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
579 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  32.14 
 
 
582 aa  200  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  28.24 
 
 
700 aa  200  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5444  putative glycerol-3-phosphate oxidase (FAD-dependent)  32.33 
 
 
559 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.93 
 
 
532 aa  199  9e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  29.25 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
552 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.65 
 
 
495 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  28.86 
 
 
520 aa  194  3e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  33.89 
 
 
517 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 
519 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.58 
 
 
502 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.06 
 
 
507 aa  194  5e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 
577 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2461  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
559 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  30.56 
 
 
585 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.44 
 
 
502 aa  193  6e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 
572 aa  193  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.85 
 
 
507 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
575 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  31.49 
 
 
559 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.24 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 
579 aa  191  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
578 aa  191  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.12 
 
 
491 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 
531 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>