More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0009 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0009  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  32.92 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  32.92 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  33.2 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3488  lysine exporter protein LysE/YggA  32.31 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  33.19 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2977  amino acid transporter LysE  33.04 
 
 		 228 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4189  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.87 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1256  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.47 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1435  amino acid transporter LysE  32.19 
 
 		 210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.410501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.2 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  34.33 
 
 		 205 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.33 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0618  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.86 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06605  putative threonine efflux protein  32.48 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7469  lysine exporter protein LysE/YggA  33.76 
 
 		 205 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0111  hypothetical protein  31.8 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1641  lysine exporter protein LysE/YggA  29.36 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.950543  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6528  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 		 205 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2768  lysine exporter protein LysE/YggA  31.17 
 
 		 221 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3142  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.91 
 
 		 208 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0269907  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4485  lysine exporter protein LysE/YggA  33.48 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.955446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 203 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.04 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  32.9 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5674  lysine exporter protein LysE/YggA  33.91 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.91 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  33.48 
 
 		 204 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2059  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 		 211 aa  119  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  30.36 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.91 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5352  lysine exporter protein LysE/YggA  31.67 
 
 		 204 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 		 203 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4118  RhtB family transporter  29.26 
 
 		 213 aa  115  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0936  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 212 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.950459  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5915  LysE family transporter  29.66 
 
 		 204 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.723016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  31.14 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1814  lysine exporter protein LysE/YggA  30.7 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000397951  hitchhiker  0.0000354309 
 
 
-
 
NC_004310  BR1920  amino acid transporter LysE  31.17 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1213  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1219  hypothetical protein  29.61 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0078  amino acid efflux protein  27.08 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1849  amino acid transporter LysE  31.17 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2939  lysine exporter protein LysE/YggA  32 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26160  hypothetical protein  32.77 
 
 		 204 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.519724  normal  0.19854 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3142  amino acid transporter LysE  27.97 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.142315  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0493  lysine exporter protein LysE/YggA  27.23 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  26.7 
 
 		 205 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3675  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.69 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2230  hypothetical protein  33.19 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3973  threonine efflux system  30.25 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.74 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02071  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.17 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0424528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0194  threonine efflux system  29.41 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.331917  normal  0.247253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4156  homoserine/threonine efflux pump  30.67 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3963  threonine efflux system  31.93 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.245678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4344  threonine efflux system  30.67 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4185  threonine efflux system  30.67 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5264  threonine efflux system  30.67 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.613043 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4290  threonine efflux system  30.67 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4047  threonine efflux system  30.67 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0194  threonine efflux system  30.25 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0335584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0732  lysine exporter protein LysE/YggA  33.04 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.824462  normal  0.397861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3644  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.23 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03702  threonine efflux system  30.25 
 
 		 206 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03651  hypothetical protein  30.25 
 
 		 206 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2482  lysine exporter protein LysE/YggA  26.13 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4190  threonine efflux system  30.25 
 
 		 206 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4153  threonine efflux system  31.51 
 
 		 207 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4239  threonine efflux system  29.41 
 
 		 206 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.588967  normal  0.890135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4346  threonine efflux system  29.41 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.459932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4286  threonine efflux system  29.41 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.492935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4167  threonine efflux system  29.41 
 
 		 206 aa  98.6  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4188  threonine efflux system  29.41 
 
 		 206 aa  98.6  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0596  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.81 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2572  hypothetical protein  27.95 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0587  lysine exporter protein LysE/YggA  29.02 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1060  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.3 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.741251  normal  0.078929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.81 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2958  threonine efflux protein  28.25 
 
 		 214 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.96 
 
 		 204 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3366  lysine exporter protein LysE/YggA  28.05 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2796  lysine exporter protein LysE/YggA  26.09 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3987  hypothetical protein  30.45 
 
 		 204 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0765  threonine efflux protein, putative  26.29 
 
 		 234 aa  95.1  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0399  putative transport protein  27.8 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0405  putative transport protein  27.8 
 
 		 210 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000145475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0717  lysine exporter protein LysE/YggA  25.11 
 
 		 204 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0417  putative transport protein  27.8 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.0110609 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0396  putative transport protein  27.8 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979225  hitchhiker  0.00000000000454708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0459  putative transport protein  27.8 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  29.66 
 
 		 215 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2743  lysine exporter protein LysE/YggA  28.25 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal  0.024176 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1110  RhtB family transporter  29 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0243  threonine efflux system  29.29 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.569169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2069  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.73 
 
 		 213 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3536  lysine exporter protein LysE/YggA  28.25 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  30.12 
 
 		 212 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0556  threonine efflux system  27.73 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>