24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3331 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  51.72 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  49.09 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  52.46 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  41.79 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  40.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2182  phage transcriptional regulator, AlpA  45.45 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0966831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  48.78 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  33.85 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  57.58 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  47.73 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  64.52 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1751  Phage transcriptional regulator, AlpA  34 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.1124  normal  0.416635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  32 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2904  phage transcriptional regulator, AlpA  46.34 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.438187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  32.84 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1361  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  40.48 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  40.48 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>