137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3108 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  59.9 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  54.55 
 
 
231 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  51.11 
 
 
231 aa  227  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  55.5 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  50.25 
 
 
222 aa  207  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  50.25 
 
 
222 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  47.85 
 
 
299 aa  184  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  46.83 
 
 
301 aa  180  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  46.83 
 
 
301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  51.37 
 
 
297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  37.73 
 
 
225 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  39.34 
 
 
231 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  43.5 
 
 
274 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  41.63 
 
 
233 aa  156  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  46.52 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  42.08 
 
 
238 aa  148  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3682  hypothetical protein  41.79 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  36.08 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  38.81 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  38.69 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  45.4 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59246  predicted protein  37.91 
 
 
399 aa  129  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.518781 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  34.98 
 
 
209 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  36.59 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  36.59 
 
 
217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04168  DUF500 and SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07880)  37.5 
 
 
410 aa  114  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  35.47 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  39.13 
 
 
267 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1499  hypothetical protein  31.19 
 
 
228 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  37.14 
 
 
225 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01250  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  35.16 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  33.74 
 
 
327 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  33 
 
 
249 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1381  hypothetical protein  29.41 
 
 
221 aa  87  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0802704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  36.26 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  32.56 
 
 
194 aa  85.9  5e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0525  putative secreted protein  28.83 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0732  putative secreted protein  28.83 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3410  protein of unknown function DUF500  30.05 
 
 
279 aa  81.6  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00830  conserved hypothetical protein  36.41 
 
 
663 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02236  DUF500 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07310)  32.39 
 
 
604 aa  79.7  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217493  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_006686  CND04590  actin filament organization-related protein, putative  36.42 
 
 
522 aa  80.1  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48746  predicted protein  31.44 
 
 
556 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1385  hypothetical protein  30.12 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10288  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  32.94 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  32.94 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  30.77 
 
 
195 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  32.74 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  38.3 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  29.22 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44183  predicted protein  27 
 
 
1316 aa  65.1  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.125536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  37.5 
 
 
192 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  36.88 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  29.09 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  33.81 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1399  hypothetical protein  31.07 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  30.15 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  31.9 
 
 
188 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  31.38 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  34.88 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  35.04 
 
 
198 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  32.84 
 
 
188 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  29.95 
 
 
195 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  34.85 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  31.58 
 
 
194 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  31.02 
 
 
195 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  33.33 
 
 
195 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  27.54 
 
 
187 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  30.26 
 
 
194 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  34.29 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31168  predicted protein  25.68 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0146707  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.22 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.22 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  30.63 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  30.63 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  29.63 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  30.63 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  30.63 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  30.63 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  30.63 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  30.63 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  30.26 
 
 
194 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  26.78 
 
 
188 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  33.82 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  35.42 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  28.89 
 
 
188 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  35.23 
 
 
178 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  28.19 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>