258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3066 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3066  siroheme synthase  100 
 
 
221 aa  427  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3282  siroheme synthase  37.61 
 
 
224 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1980  precorrin-2 dehydrogenase  47.73 
 
 
194 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00160437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1261  siroheme synthase  45.12 
 
 
209 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1463  siroheme synthase  37.56 
 
 
226 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438897  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1249  siroheme synthase  34.57 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1123  siroheme synthase  32.55 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.967334 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.85 
 
 
484 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3236  siroheme synthase  31.82 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0304551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0362  siroheme synthase  35.19 
 
 
249 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0298  siroheme synthase  34.91 
 
 
228 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0400  siroheme synthase  32.61 
 
 
212 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3231  precorrin-2 dehydrogenase  39.63 
 
 
224 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000236198  normal  0.247587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0405  siroheme synthase  37.95 
 
 
224 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00161187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  32.99 
 
 
489 aa  101  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2023  precorrin-2 dehydrogenase  34.72 
 
 
225 aa  101  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.089983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1251  precorrin-2 dehydrogenase  41.33 
 
 
214 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.264543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3379  siroheme synthase  33.5 
 
 
197 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1933  uroporphyrin-III C-methyltransferase  37.2 
 
 
495 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2072  siroheme synthase  40.25 
 
 
235 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  hitchhiker  0.0000044464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1588  siroheme synthase  33.33 
 
 
257 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0580  siroheme synthase  38.75 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0321  glutamate-1-semialdehyde-2,1-aminomutase  31.13 
 
 
626 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00115564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1349  siroheme synthase  34.98 
 
 
213 aa  99.4  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3311  hypothetical protein  35.55 
 
 
226 aa  98.6  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.17565  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1748  siroheme synthase  32.88 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1745  siroheme synthase  35.62 
 
 
198 aa  95.9  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12390  siroheme synthase, N-terminal domain protein  36.48 
 
 
255 aa  95.1  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2635  precorrin-2 dehydrogenase  33.52 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.917436  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2165  siroheme synthase  30.22 
 
 
190 aa  94.7  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.576163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1283  siroheme synthase  41.22 
 
 
280 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.49 
 
 
482 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5870  siroheme synthase  36.42 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115348  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0683  precorrin-2 dehydrogenase / sirohydrochlorin ferrochelatase  29.47 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000339701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1150  precorrin-2 dehydrogenase  33.12 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3090  siroheme synthase  33.11 
 
 
498 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000482671  normal  0.0254521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0405  siroheme synthase  38.55 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.58 
 
 
481 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2374  precorrin-2 dehydrogenase  28.87 
 
 
200 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1616  siroheme synthase  34.29 
 
 
225 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0652  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  36.42 
 
 
493 aa  88.6  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.67 
 
 
470 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1099  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.14 
 
 
484 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.656193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3356  siroheme synthase  32.93 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0422337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1483  precorrin-2 dehydrogenase  36.24 
 
 
204 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3861  precorrin-2 dehydrogenase  36.24 
 
 
204 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.458104  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0961  siroheme synthase  43.48 
 
 
234 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3989  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  35.22 
 
 
480 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0569779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0478  siroheme synthase  29.7 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  0.875071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  26.47 
 
 
458 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0572  precorrin-3B C17-methyltransferase  41.89 
 
 
800 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3617  precorrin-2 dehydrogenase  35.33 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370108 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.46 
 
 
473 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003419  siroheme synthase/precorrin-2 oxidase/sirohydrochlorin ferrochelatase  28.64 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.827256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11590  siroheme synthase, N-terminal domain protein  34.46 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  29.41 
 
 
464 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  31.22 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  30.73 
 
 
465 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0863  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  32.12 
 
 
468 aa  81.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.147258  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.39 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02359  hypothetical protein  28.37 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0708  siroheme synthase  26.95 
 
 
153 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  25.93 
 
 
554 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1264  precorrin-3B C17-methyltransferase  45.45 
 
 
778 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0204  precorrin-2 dehydrogenase  30.61 
 
 
149 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0854  siroheme synthase  35.26 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.819849  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3656  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.48 
 
 
470 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1823  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.1629  normal  0.347271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  29.56 
 
 
464 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6615  siroheme synthase  28.05 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.027684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0298  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase and uroporphyrinogen methyltransferase  30.67 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0976  siroheme synthase component enzyme  28.91 
 
 
312 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.417242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1669  siroheme synthase  32.31 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1704  siroheme synthase  28.47 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.92 
 
 
464 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2307  porphyrin biosynthesis protein, putative  25.35 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.187642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  36.59 
 
 
457 aa  78.2  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4780  siroheme synthase  29.63 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000000392652  hitchhiker  0.00414073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  30.48 
 
 
462 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  29.06 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0710  siroheme synthase  27.86 
 
 
148 aa  77.4  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  36.59 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06710  siroheme synthase Met8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05680)  31.25 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2188  precorrin-2 dehydrogenase  26.25 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3154  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.61 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0503959  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  36.59 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  36.59 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  36.59 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1636  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 
478 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0591457  normal  0.234749 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3603  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.3 
 
 
455 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525458  normal  0.155845 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1111  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
482 aa  76.3  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2089  ferrochelatase  33.68 
 
 
474 aa  75.9  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0691041  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2058  virulence protein VirC  27.92 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1945  precorrin-2 dehydrogenase  29.7 
 
 
157 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.996395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0141  porphyrin biosynthesis protein, putative  26.06 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2332  siroheme synthase  28.91 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.477134  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  35.37 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2289  precorrin-2 dehydrogenase  29.09 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.69 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0637  precorrin-3B C17-methyltransferase  44.19 
 
 
837 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.647433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>