More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3038 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  98.84 
 
 		 516 aa  1068    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  97.67 
 
 		 516 aa  1056    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  100 
 
 		 516 aa  1078    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  100 
 
 		 516 aa  1078    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  100 
 
 		 516 aa  1078    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0985  transposase, IS4 family protein  44.78 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1395  transposase IS4 family protein  43.39 
 
 		 510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1744  transposase IS4 family protein  42.2 
 
 		 531 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1929  IS4 family transposase  47.85 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.121993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  27.38 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  27.18 
 
 		 486 aa  153  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  29.92 
 
 		 444 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  26.71 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  26.71 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  25.48 
 
 		 472 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  25.05 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  25.05 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  25.05 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1536  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1749  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269011  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3125  transposase, IS4  24.86 
 
 		 536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000237223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  29.25 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  23.79 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  24.55 
 
 		 493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  23.6 
 
 		 481 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  26.96 
 
 		 440 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  24.35 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  24.27 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  24.36 
 
 		 478 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  26.72 
 
 		 440 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2792  transposase  24.5 
 
 		 545 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  24.32 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0273  transposase, IS4  25.15 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0241108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0145  transposase  24.31 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0416  transposase  24.31 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.415118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1176  transposase  24.31 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1524  transposase  24.31 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419184  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3115  transposase  24.31 
 
 		 545 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.960078  hitchhiker  0.00180053 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  24.03 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  24.03 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  22.64 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  25.54 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  24.18 
 
 		 482 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  26.86 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  26.64 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  27.2 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>