100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2999 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  100 
 
 		 388 aa  786    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  47.09 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  45.21 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  34.38 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  35.6 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  34.1 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 		 291 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  30.86 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 		 291 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  31.11 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  30.48 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  31.75 
 
 		 295 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 295 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  31.29 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 297 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  30.67 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  30.34 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  29.49 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 293 aa  126  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  29.77 
 
 		 292 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  30.34 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  31.68 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 293 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  30.5 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 292 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  28.35 
 
 		 300 aa  114  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 295 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 292 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  26.18 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  26.4 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.49 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  29.62 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2061  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 294 aa  99.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.952171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0066  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 293 aa  98.6  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.628263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  27.7 
 
 		 293 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  27.83 
 
 		 308 aa  97.1  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 292 aa  96.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  24.2 
 
 		 297 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0622  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.044899  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  25.87 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2640  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.09 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1019  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16730  Fe-S oxidoreductase  27.57 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.359613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1372  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3579  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.630491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1085  histone acetyltransferase, ELP3 family  30.16 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.707697  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0889  ELP3 family histone acetyltransferase  20.49 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25380  Fe-S oxidoreductase  22.09 
 
 		 300 aa  57  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.76381  normal  0.564969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  33.01 
 
 		 351 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00660  Fe-S oxidoreductase  23.4 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0824  ELP3 family histone acetyltransferase  26.83 
 
 		 541 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1093  ELP3 family histone acetyltransferase  28.23 
 
 		 541 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.108771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1832  ELP3 family histone acetyltransferase  27.42 
 
 		 541 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1989  ELP3 family histone acetyltransferase  30.97 
 
 		 548 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0347  putative radical SAM protein  29.73 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0515  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.11 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.84475  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0898  ELP3 family histone acetyltransferase  29.27 
 
 		 512 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.589047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1156  putative radical SAM protein  25.39 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0308267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  26.25 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1501  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.166226  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0279  ELP3 family histone acetyltransferase  19.53 
 
 		 563 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11040  histone acetyltransferase  30.83 
 
 		 666 aa  47.8  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.142131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1404  radical SAM protein, putative histone acetyltransferase  32.46 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000266579  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  21.36 
 
 		 715 aa  47.4  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1318  ELP3 family histone acetyltransferase  28.12 
 
 		 510 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.340377 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0088  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 477 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0202426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3496  hypothetical protein  60 
 
 		 38 aa  46.6  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1713  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.42 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1358  putative radical SAM protein  26.96 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.161503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0300  hypothetical protein  27.66 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.558235  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0122  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1640  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 		 317 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1944  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0450295  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1167  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.413437  normal  0.627812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.96 
 
 		 485 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0572  conserved hypothetical radical SAM protein  25.66 
 
 		 325 aa  43.5  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0760  putative radical SAM protein  25.95 
 
 		 304 aa  43.5  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.992819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 444 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 518 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>