More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2988 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 806 aa  1622    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 842 aa  243  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  39.21 
 
 		 840 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  45.63 
 
 		 843 aa  228  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  40.56 
 
 		 877 aa  227  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  39.94 
 
 		 825 aa  226  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  42.29 
 
 		 299 aa  224  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.91 
 
 		 859 aa  224  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.41 
 
 		 795 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  41.61 
 
 		 1118 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  47.11 
 
 		 291 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  41.61 
 
 		 1118 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  41.61 
 
 		 1120 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  41.61 
 
 		 1118 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  41.61 
 
 		 1120 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  47.73 
 
 		 685 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  50 
 
 		 807 aa  217  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  47.32 
 
 		 864 aa  217  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  40.97 
 
 		 1120 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  40.97 
 
 		 1120 aa  216  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  40.97 
 
 		 1120 aa  216  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 		 861 aa  214  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  38.28 
 
 		 796 aa  213  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  40.21 
 
 		 1120 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 		 1120 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1120 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  40.21 
 
 		 1120 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1120 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1118 aa  211  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1120 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  44.76 
 
 		 816 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1120 aa  211  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  40.21 
 
 		 1120 aa  211  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  34.35 
 
 		 832 aa  210  7e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  46.09 
 
 		 636 aa  210  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 752 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 		 1110 aa  209  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  37.54 
 
 		 845 aa  209  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  37.47 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  40.54 
 
 		 1115 aa  208  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  46.06 
 
 		 636 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  44.4 
 
 		 874 aa  208  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 843 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  42.59 
 
 		 298 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  39.44 
 
 		 849 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  40.23 
 
 		 847 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40.23 
 
 		 847 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  38.77 
 
 		 1144 aa  203  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.54 
 
 		 844 aa  203  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  43.46 
 
 		 784 aa  202  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  45.26 
 
 		 1098 aa  202  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  39.54 
 
 		 322 aa  201  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  34.21 
 
 		 830 aa  201  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  41.8 
 
 		 1110 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  37.63 
 
 		 1133 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 981 aa  197  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  41.6 
 
 		 866 aa  197  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  38.81 
 
 		 1128 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  36.63 
 
 		 1130 aa  196  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  35.46 
 
 		 1166 aa  196  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  38.27 
 
 		 1127 aa  194  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  42.19 
 
 		 1158 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  38.2 
 
 		 1111 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  41.88 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 1235 aa  192  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  44.86 
 
 		 860 aa  192  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  37.32 
 
 		 879 aa  191  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 472 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 560 aa  191  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  38.13 
 
 		 1117 aa  190  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  40.65 
 
 		 1105 aa  190  9e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 		 862 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  39.13 
 
 		 444 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  24.86 
 
 		 833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  42.66 
 
 		 338 aa  185  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 		 867 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 883 aa  184  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  34.96 
 
 		 1134 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  33.45 
 
 		 1117 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.02 
 
 		 891 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.02 
 
 		 785 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  33.02 
 
 		 1118 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  40.56 
 
 		 303 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  37.93 
 
 		 825 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 909 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 947 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.77 
 
 		 1134 aa  180  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 		 909 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  34.77 
 
 		 1118 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  34.87 
 
 		 447 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.61 
 
 		 753 aa  178  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  36.76 
 
 		 910 aa  179  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1102 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 1066 aa  177  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  35.36 
 
 		 1102 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 1068 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 1060 aa  177  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 1067 aa  177  7e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 1067 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 1067 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>