More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2979 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  100 
 
 		 415 aa  821    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  57.79 
 
 		 402 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  59.35 
 
 		 402 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  58.35 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  59.6 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  59.09 
 
 		 402 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  56.15 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  49.62 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  47.24 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  48.76 
 
 		 403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  48.26 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.37 
 
 		 403 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 402 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  42.6 
 
 		 403 aa  335  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  48.26 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  42.32 
 
 		 402 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  50.13 
 
 		 404 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.81 
 
 		 403 aa  320  3e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  46.52 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  41.75 
 
 		 403 aa  319  7e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  41.92 
 
 		 402 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  47.87 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  47.12 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  43.97 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  47.12 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  40.98 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  47.51 
 
 		 403 aa  313  4.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  40.72 
 
 		 403 aa  312  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  41.31 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  46.4 
 
 		 443 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  48.99 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  41.96 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  45.29 
 
 		 416 aa  308  9e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  47.04 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  45.75 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  38.56 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  40.2 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  47.87 
 
 		 406 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.42 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  47.06 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  45.43 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  47.33 
 
 		 404 aa  293  4e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  47.06 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  45.73 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 412 aa  292  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  46.21 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  47.13 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  45.48 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  43.75 
 
 		 421 aa  288  9e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  42.42 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.99 
 
 		 399 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42.17 
 
 		 403 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  48.37 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  44.7 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.7 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 407 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.85 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.38 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  44.7 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  52.2 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.09 
 
 		 403 aa  269  8.999999999999999e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  41.84 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 402 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1888  threonine dehydratase  45.57 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  42.32 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  43.32 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  40.74 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  44.72 
 
 		 410 aa  262  8e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  45.29 
 
 		 408 aa  262  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  39.79 
 
 		 410 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.11 
 
 		 411 aa  259  5.0000000000000005e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  45.71 
 
 		 413 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  44 
 
 		 402 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  40.99 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  34.33 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  42.64 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 398 aa  249  7e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  43.07 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  38.4 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  41.99 
 
 		 414 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  40.94 
 
 		 415 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  43.97 
 
 		 403 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  42.03 
 
 		 415 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  41.09 
 
 		 415 aa  235  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>