More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2948 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  100 
 
 		 478 aa  951    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  49.27 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  52.24 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  49.79 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  49.48 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  48.55 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  49.17 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.96 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  54.82 
 
 		 388 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  45.62 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  46.46 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  46.46 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  44.12 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  44.75 
 
 		 464 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  47.14 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  45.41 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.42 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.08 
 
 		 461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  44.14 
 
 		 485 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.14 
 
 		 464 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  43.97 
 
 		 469 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  40.64 
 
 		 502 aa  332  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.77 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  43.02 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  39.73 
 
 		 485 aa  319  5e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.63 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41 
 
 		 473 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.12 
 
 		 474 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  43.47 
 
 		 474 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  42.12 
 
 		 474 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  42.92 
 
 		 450 aa  315  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  39.04 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  39.51 
 
 		 476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.33 
 
 		 473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  39.83 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  40.51 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  42.09 
 
 		 481 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.9 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.3 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.3 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.3 
 
 		 450 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  40.3 
 
 		 450 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  40.3 
 
 		 450 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  42.28 
 
 		 499 aa  312  6.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  40.6 
 
 		 450 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.3 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  43.15 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.82 
 
 		 506 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  41.56 
 
 		 524 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  42.44 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  37.72 
 
 		 502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  41.98 
 
 		 498 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  40.94 
 
 		 475 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  40.51 
 
 		 451 aa  310  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  41 
 
 		 484 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  40.09 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.31 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.31 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  42.47 
 
 		 449 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  41.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.96 
 
 		 477 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.96 
 
 		 492 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.29 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  41.37 
 
 		 482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  42.04 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  42.67 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.01 
 
 		 504 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  40.77 
 
 		 451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  41.13 
 
 		 523 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  42.27 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  38.15 
 
 		 525 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  42.4 
 
 		 498 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  42.07 
 
 		 497 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  41.95 
 
 		 455 aa  302  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.79 
 
 		 465 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.88 
 
 		 505 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  38.26 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  38.26 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  38.26 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  38.26 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  43.06 
 
 		 472 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  38.26 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.6 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  38.26 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.42 
 
 		 503 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  38.26 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  39.83 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  43.34 
 
 		 450 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  39.45 
 
 		 491 aa  300  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.14 
 
 		 460 aa  299  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  41.26 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  43.07 
 
 		 492 aa  299  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  38.04 
 
 		 474 aa  299  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  39.29 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  40.35 
 
 		 503 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  42.65 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.83 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  41.22 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  44.47 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  41.13 
 
 		 524 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>