More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2884 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 447 aa  921    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  61.52 
 
 		 451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  56.14 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  48.96 
 
 		 446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  46.64 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  49.88 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  46.43 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  44.06 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  42.7 
 
 		 446 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  44.54 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  46.98 
 
 		 421 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  41.22 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 461 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  33.91 
 
 		 513 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 372 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 341 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.26 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.84 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  21.46 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 		 873 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.24 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.05 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  21.45 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.11 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.22 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.54 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  33.33 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  27.04 
 
 		 311 aa  62.8  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 		 329 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  29.38 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.76 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.14 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.05 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.36 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.95 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0217  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.44 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  23.87 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.39 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  28.4 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  28.48 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  21.38 
 
 		 503 aa  57.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 345 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 355 aa  57  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.87 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  32.23 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.93 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  26.53 
 
 		 404 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.28 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.69 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1832  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3571  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.76 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.9 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.46 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.82 
 
 		 326 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  25.57 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 338 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.97 
 
 		 326 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  24.23 
 
 		 337 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  26.79 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  27.47 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3033  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 468 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.02 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 543 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 407 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  22.27 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>