115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2857 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2857  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  332  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3014  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  78.29 
 
 
175 aa  275  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  68.6 
 
 
174 aa  248  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000820343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1977  hypothetical protein  68 
 
 
175 aa  243  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.52467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2970  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  67.43 
 
 
175 aa  222  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1867  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  57.89 
 
 
176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340851  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1596  hypothetical protein  61.27 
 
 
173 aa  167  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1169  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.77 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2311  YeeE/YedE family protein  41.04 
 
 
185 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.248702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1628  YeeE/YedE family protein  48.12 
 
 
185 aa  142  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0625  YeeE/YedE family protein  47.4 
 
 
186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1696  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  47.18 
 
 
185 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000839516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3683  hypothetical protein  39.16 
 
 
186 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133459  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3345  hypothetical protein  42.95 
 
 
192 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0802  YeeE/YedE family protein  44.37 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0511  rhodanese domain-containing protein  32.39 
 
 
647 aa  95.9  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4309  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.97 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1462  rhodanese domain-containing protein  33.15 
 
 
419 aa  88.2  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1834  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.26 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  32.52 
 
 
373 aa  78.6  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0557  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.43 
 
 
218 aa  74.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000311209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4107  hypothetical protein  36.22 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.159801  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0348  hypothetical protein  33.12 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.176837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0170  hypothetical protein  29.63 
 
 
168 aa  71.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0789  rhodanese domain-containing protein  29.73 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.259144  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.81 
 
 
352 aa  62.4  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  33.6 
 
 
140 aa  62  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0517637  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2715  hypothetical protein  26.23 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2810  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.23 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151764  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0743  hypothetical protein  29.13 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0259  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0761  hypothetical protein  29.13 
 
 
141 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2629  hypothetical protein  25.68 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3803  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.77 
 
 
159 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1494  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.5 
 
 
151 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12638  hypothetical protein  30.25 
 
 
137 aa  54.7  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.155305  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0179  hypothetical protein  31.88 
 
 
140 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0960406 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.95 
 
 
330 aa  53.9  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2424  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  54.17 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2821  YeeE/YedE  28.93 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1617  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.01 
 
 
155 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000235117  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3388  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 
290 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530669  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1029  transporter component  29.75 
 
 
136 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.489636  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2996  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.2 
 
 
138 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270822  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2717  putative transmembrane protein  52.17 
 
 
145 aa  51.6  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.430546  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2518  hypothetical protein  33.05 
 
 
145 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.042231 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1759  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.11 
 
 
332 aa  51.2  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000112803  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6935  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.16 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6242  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.94 
 
 
151 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.937255  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0813  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.99 
 
 
148 aa  51.2  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.54396  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4883  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.07 
 
 
159 aa  51.2  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0848134  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0192  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.99 
 
 
140 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11773  hypothetical protein  28 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3704  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  55.56 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.546913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00083  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.77 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3903  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.06 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0456636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3330  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.77 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  hitchhiker  0.00106524 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5674  putative transporter component domain-containing protein  33.33 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0313  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.56 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2677  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.17 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0437  hypothetical protein  34.4 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.275295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3296  YeeE/YedE family protein  31.03 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0103  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  47.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  32.71 
 
 
354 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5602  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.35 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723965  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0328  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.56 
 
 
137 aa  47.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  26.67 
 
 
344 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1367  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.09 
 
 
157 aa  47.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3115  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  25.62 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2078  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.47 
 
 
144 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4847  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  31.45 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2894  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.01 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.938885  normal  0.236588 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3646  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.73 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.415893  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1915  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.3 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1810  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.91 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2607  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.87 
 
 
138 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0601  hypothetical protein  29.41 
 
 
361 aa  45.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2176  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.65 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.522142  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1055  hypothetical protein  21.51 
 
 
371 aa  44.3  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3142  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  50 
 
 
138 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.440254  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1336  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.96 
 
 
152 aa  44.3  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377918 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0939  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0357  YeeE/YedE family protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3633  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0443  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0204  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1898  hypothetical protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1812  YeeE/YedE family protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1402  YeeE/YedE family protein  29.55 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.218972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3749  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.23 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1027  hypothetical protein  44.68 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645004  normal  0.157652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6794  hypothetical protein  28.77 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0398  hypothetical protein  30.08 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1744  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  45.24 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.157818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1572  hypothetical protein  27.12 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01940  hypothetical protein  51.11 
 
 
139 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>