More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2772 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  100 
 
 
358 aa  745    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  66.86 
 
 
357 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  65.17 
 
 
357 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  64.57 
 
 
355 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  64.59 
 
 
356 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  64.31 
 
 
356 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  63.74 
 
 
357 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  51.33 
 
 
362 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  45.94 
 
 
357 aa  338  9e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  44.94 
 
 
358 aa  331  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  44.66 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  42.37 
 
 
360 aa  279  7e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  38.94 
 
 
373 aa  238  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  36.06 
 
 
375 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  38.24 
 
 
370 aa  229  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  36.34 
 
 
370 aa  229  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.69 
 
 
382 aa  223  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.8 
 
 
382 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  35.96 
 
 
370 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.21 
 
 
382 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.5 
 
 
382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  35.77 
 
 
385 aa  205  9e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  36.44 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  36.06 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  34.54 
 
 
382 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  34.18 
 
 
382 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  34.18 
 
 
382 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  35.91 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  34.27 
 
 
382 aa  189  5e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  33.82 
 
 
382 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  33.24 
 
 
386 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.74 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.68 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  35.17 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.24 
 
 
380 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.41 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  32.68 
 
 
384 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.7 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.71 
 
 
383 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  33.24 
 
 
383 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  33.8 
 
 
384 aa  179  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  33.24 
 
 
363 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  34.81 
 
 
384 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  31.07 
 
 
384 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  31.07 
 
 
384 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  31.45 
 
 
383 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  34.08 
 
 
397 aa  176  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  31.82 
 
 
360 aa  176  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.93 
 
 
362 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  33.14 
 
 
401 aa  175  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.14 
 
 
377 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.93 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  33.53 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  30.75 
 
 
387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  32.21 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  33.24 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  33.72 
 
 
417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  33.24 
 
 
384 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.65 
 
 
385 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  32.94 
 
 
399 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  34.08 
 
 
402 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  31.99 
 
 
380 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.11 
 
 
381 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.14 
 
 
417 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.8 
 
 
402 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  33.8 
 
 
402 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  32.56 
 
 
391 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  33.53 
 
 
421 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  33.53 
 
 
382 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  31.52 
 
 
380 aa  170  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  33.24 
 
 
360 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  32.27 
 
 
391 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.83 
 
 
382 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  32.48 
 
 
391 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  31.9 
 
 
391 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  33.92 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  32.56 
 
 
391 aa  166  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  29.17 
 
 
386 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.11 
 
 
381 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  32.38 
 
 
396 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  31.5 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  33.14 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  31.36 
 
 
381 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  32.24 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3194  aminotransferase class V  32.87 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  34.31 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  32.85 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3093  aminotransferase class V  32.87 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  28.97 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2994  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.58 
 
 
395 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  34.16 
 
 
400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28.97 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28.97 
 
 
385 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.17 
 
 
384 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  31.1 
 
 
396 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  30.86 
 
 
387 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  28.9 
 
 
379 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  30.95 
 
 
398 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  32.76 
 
 
403 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  31.61 
 
 
406 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>