180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2751 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  100 
 
 		 326 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  32.74 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  31.86 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  31.61 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  32.66 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  29.33 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  28.05 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  35.78 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  25.25 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1960  hypothetical protein  27.36 
 
 		 327 aa  90.9  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0139154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  28.12 
 
 		 359 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0668  hypothetical protein  29.67 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  26.47 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  27.2 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  27.03 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0403  hypothetical protein  28.63 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  30.68 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  24.04 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  28.42 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  27.6 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  27.59 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44090  PqiB family protein  28.44 
 
 		 537 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.760607  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  26.73 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  24.41 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5506  hypothetical protein  27.67 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.286213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  27.44 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  30.2 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  28.06 
 
 		 559 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  29.09 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3242  Mammalian cell entry related domain protein  26.91 
 
 		 555 aa  59.7  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  25.81 
 
 		 548 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  26.19 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.94 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  21.94 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  27.76 
 
 		 550 aa  59.3  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  22.99 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3915  hypothetical protein  28.62 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.06 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0579  hypothetical protein  25.1 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1445  Mammalian cell entry related domain protein  24.28 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2221  Mammalian cell entry related domain protein  23.66 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000538523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  40.91 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1127  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0201216  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.62 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  25.93 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  25.93 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1022  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00119913  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1139  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0102675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1173  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.371767  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  23.73 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  25.3 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1105  paraquat-inducible protein B  26.72 
 
 		 546 aa  56.6  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486337  normal  0.0294366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3288  hypothetical protein  22.54 
 
 		 546 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  23.85 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2679  hypothetical protein  25.53 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.331347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3139  hypothetical protein  22.27 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  25.89 
 
 		 572 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0328  Mammalian cell entry related domain protein  24.56 
 
 		 552 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  30.57 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0651  hypothetical protein  25.71 
 
 		 534 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1317  normal  0.879007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00955  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000262354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2168  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000764872  normal  0.254429 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0257  hypothetical protein  24 
 
 		 543 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00962  hypothetical protein  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000379419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1713  hypothetical protein  37.84 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000187754 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1060  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012177  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1066  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000823988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2577  hypothetical protein  21.85 
 
 		 546 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  23.67 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  27.17 
 
 		 546 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2000  Mammalian cell entry related domain protein  23.72 
 
 		 558 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939676  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  27.68 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  29.05 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  25.3 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  28.69 
 
 		 548 aa  52  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3328  hypothetical protein  27.1 
 
 		 694 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.901171  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2692  hypothetical protein  27.87 
 
 		 688 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  22.19 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  24.87 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2580  hypothetical protein  22.83 
 
 		 551 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.732971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  24.03 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1704  hypothetical protein  26.85 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  23.78 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  28.09 
 
 		 312 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  32.85 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  26.42 
 
 		 546 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  21.04 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  24.03 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1363  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.498606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.88 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  28.09 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>