More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2749 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  100 
 
 		 386 aa  776    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  54.4 
 
 		 375 aa  355  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  47.92 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  41.54 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  36.77 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  44.06 
 
 		 372 aa  212  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  34.43 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  46.44 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  35.62 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  43.27 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  35.2 
 
 		 383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  42.57 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  38.74 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  40.77 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  35.38 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  31.33 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  31.33 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  35.48 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  37.78 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  42.16 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  37.97 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  35.12 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  37.86 
 
 		 370 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  34.44 
 
 		 366 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  34.81 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  34.68 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  30.77 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  35.79 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  43.58 
 
 		 386 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  33.16 
 
 		 370 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  28.89 
 
 		 373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  30.81 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0799  protein of unknown function DUF140  47.94 
 
 		 216 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.745929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  41.08 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  34.72 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  42.23 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  39.93 
 
 		 373 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  34.96 
 
 		 388 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  32.55 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  34.2 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  33.62 
 
 		 372 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  40.66 
 
 		 406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  34.17 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  35.85 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  39.23 
 
 		 382 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  32.82 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  39.41 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  34.05 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  36.07 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  30.85 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  28.34 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  33.13 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.12 
 
 		 382 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  27.42 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  28.03 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  28.03 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  34.47 
 
 		 377 aa  169  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  35.56 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  35.56 
 
 		 378 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  41.85 
 
 		 382 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  35.98 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  30.93 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37.6 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  35.96 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  39.46 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  42.45 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  36.01 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  39.08 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  34.77 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  30.3 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.72 
 
 		 377 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  39.45 
 
 		 257 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  35.95 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  39.08 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  29.8 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  31.4 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  28.97 
 
 		 375 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  33.73 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  37.25 
 
 		 384 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  33.59 
 
 		 373 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  34.31 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  35.27 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  37.83 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  35.56 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  31.86 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  38.7 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  32.17 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  36.47 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  36.47 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  33.97 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1984  protein of unknown function DUF140  30.41 
 
 		 383 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.622106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  32.28 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  31.5 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  34.48 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  34.48 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  29.52 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  34.05 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>