More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2692 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 356 aa  734    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  70.54 
 
 		 355 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  70.25 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  69.97 
 
 		 359 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  70.82 
 
 		 355 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  69.69 
 
 		 354 aa  511  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  66.29 
 
 		 355 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  67.71 
 
 		 355 aa  498  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  65.16 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  64.02 
 
 		 357 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  63.74 
 
 		 356 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  61.41 
 
 		 356 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  64.31 
 
 		 357 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  59.15 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0733  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4456  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0761  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.169079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 		 355 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 363 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1060  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0774  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 360 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2337  peptide chain release factor 1  60.34 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 357 aa  441  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  59.94 
 
 		 363 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 		 355 aa  441  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61700  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1424  peptide chain release factor 1  61.47 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.997988  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1051  peptide chain release factor 1  59.89 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0598725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1109  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 360 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2284  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2257  peptide chain release factor 1  58.17 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  59.14 
 
 		 353 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  57.95 
 
 		 361 aa  440  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 360 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  58.12 
 
 		 355 aa  434  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  59.09 
 
 		 360 aa  437  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 363 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  60.43 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000361971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5314  peptide chain release factor 1  58.92 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  56.94 
 
 		 359 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0278  peptide chain release factor 1  59.21 
 
 		 361 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.728879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  58.36 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  58.24 
 
 		 357 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3251  peptide chain release factor 1  61.76 
 
 		 360 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.227833  normal  0.0955024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  56.21 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1856  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 		 362 aa  430  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01186  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.304726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2436  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000671796  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1692  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0012914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01196  hypothetical protein  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.26987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1931  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000608431  normal  0.0690317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3459  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1077  peptide chain release factor 1  55.93 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1359  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000344623  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0790  peptide chain release factor 1  56.57 
 
 		 362 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.224449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  58.64 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0509  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  56.06 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  58.57 
 
 		 360 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 362 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 360 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  55.77 
 
 		 358 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2415  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  hitchhiker  0.000030401 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0950  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.568062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3685  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0369473  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  58.69 
 
 		 355 aa  425  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1316  peptide chain release factor 1  61.19 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000610156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  55.49 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  58.29 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  57.83 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4748  peptide chain release factor 1  57.51 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.0645708 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  57.1 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1457  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 		 364 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0262209  normal  0.168501 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1375  peptide chain release factor 1  60.91 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41470  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.711816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  58 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0920  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 		 361 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000562935  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0522  peptide chain release factor 1  57.79 
 
 		 361 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  58.86 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  58.86 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0793  peptide chain release factor 1  55.11 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.510985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  58.86 
 
 		 360 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004203  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0254288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1248  peptide chain release factor 1  52.65 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2930  peptide chain release factor 1  57.55 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  55.46 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>