More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2691 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  55.52 
 
 
284 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  53.41 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  53.76 
 
 
284 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  53.57 
 
 
286 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  55.75 
 
 
288 aa  275  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  52.67 
 
 
285 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.96 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  50.88 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  45.55 
 
 
301 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  46.08 
 
 
297 aa  227  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.83 
 
 
288 aa  226  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  45.52 
 
 
296 aa  223  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  43.25 
 
 
297 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  41.75 
 
 
285 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  43.2 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.87 
 
 
297 aa  211  9e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.89 
 
 
295 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  42.37 
 
 
297 aa  206  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.56 
 
 
297 aa  206  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  42.66 
 
 
289 aa  206  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.79 
 
 
286 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.68 
 
 
289 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  46.57 
 
 
285 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  45.83 
 
 
299 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  43.51 
 
 
282 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.15 
 
 
296 aa  202  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.91 
 
 
299 aa  202  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  44.56 
 
 
304 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  45.68 
 
 
286 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  45 
 
 
286 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  46.49 
 
 
291 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  42.7 
 
 
302 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  41.22 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  43.12 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  44.93 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  47.17 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  46.82 
 
 
317 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.53 
 
 
293 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  44.65 
 
 
295 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  45.52 
 
 
298 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  46.27 
 
 
292 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  48.46 
 
 
280 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  43.02 
 
 
295 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.83 
 
 
284 aa  188  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  42.08 
 
 
279 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  39.64 
 
 
285 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  47.69 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.77 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2113  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  45.35 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  44.44 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.09 
 
 
276 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  45.49 
 
 
279 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  42.86 
 
 
285 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.25 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  42.21 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1755  hemK protein  42.34 
 
 
286 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  43.68 
 
 
280 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  46.53 
 
 
276 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.92 
 
 
276 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.49 
 
 
276 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  47.08 
 
 
275 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  46.53 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  43.43 
 
 
276 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  39.42 
 
 
284 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.53 
 
 
276 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14250  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.02 
 
 
314 aa  177  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.537265  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.49 
 
 
285 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  48.54 
 
 
275 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  44.06 
 
 
283 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4455  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45 
 
 
276 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0690  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.8 
 
 
285 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.14 
 
 
276 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1364  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.38 
 
 
277 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000140112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1548  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.38 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.299317 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  40.96 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1906  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.38 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  0.396695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  43.31 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1912  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.38 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  45.45 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  47.27 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  41.24 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  41.61 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1970  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  43.38 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.017955  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  45.15 
 
 
283 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  43.07 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  39.93 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  44.56 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  43.89 
 
 
278 aa  172  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  44.31 
 
 
294 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3125  HemK family modification methylase  39.71 
 
 
280 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  42.11 
 
 
293 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2406  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  44.4 
 
 
281 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  40.42 
 
 
285 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3250  protein methyltransferase hemK  42.59 
 
 
288 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0880397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  46.36 
 
 
293 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  40.98 
 
 
298 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  39.76 
 
 
279 aa  170  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  46.06 
 
 
274 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  44.91 
 
 
284 aa  169  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>