More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2660 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  100 
 
 		 344 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  45.13 
 
 		 497 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1695  tungsten-containing aldehyde ferredoxin oxidoreductase cofactor modifying protein  32.74 
 
 		 291 aa  159  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.327054 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.4 
 
 		 349 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  29.61 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.55 
 
 		 346 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  25.48 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3165  Radical SAM domain protein  29.79 
 
 		 343 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  26.24 
 
 		 561 aa  115  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 380 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.86 
 
 		 479 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 		 359 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 389 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 		 347 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  26.1 
 
 		 769 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  25.6 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.07 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.58 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 347 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 381 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 347 aa  95.9  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  23.01 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  21.24 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24.08 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.01 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.07 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  24.2 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  20.94 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  23.15 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  22.94 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  22.71 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  26.07 
 
 		 373 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.83 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 420 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  23.38 
 
 		 378 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  23.38 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  23.8 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  23.38 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.13 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  20.59 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  23.58 
 
 		 422 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2450  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.702172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  20.59 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 438 aa  87.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  22.82 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.91 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  22.6 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.3 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  25.27 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.99 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.54 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  21.24 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 370 aa  82.4  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>