165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2586 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  51.08 
 
 
237 aa  242  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  52.99 
 
 
238 aa  239  3e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  52.54 
 
 
238 aa  238  6e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  47.41 
 
 
248 aa  228  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  45.06 
 
 
238 aa  214  9e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  44.35 
 
 
244 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  42.49 
 
 
245 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  44.64 
 
 
251 aa  197  8e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.49 
 
 
241 aa  195  5e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  43.78 
 
 
254 aa  194  8e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  43.78 
 
 
254 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  43.78 
 
 
254 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  43.78 
 
 
254 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  42.55 
 
 
252 aa  189  3e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  42.36 
 
 
244 aa  187  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  42.49 
 
 
252 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  4.4786e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  43.67 
 
 
245 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  41.63 
 
 
239 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  42.42 
 
 
245 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  43.67 
 
 
245 aa  184  1e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  184  1e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  183  2e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  43.23 
 
 
245 aa  183  2e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  42.06 
 
 
251 aa  183  2e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  41.2 
 
 
248 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.75833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  41.48 
 
 
249 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  40.34 
 
 
247 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  44.54 
 
 
245 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  42.36 
 
 
245 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.86023e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  42.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  42.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  42.79 
 
 
245 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  39.15 
 
 
239 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  43.35 
 
 
246 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  41.48 
 
 
245 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  42.55 
 
 
260 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  42.36 
 
 
245 aa  175  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  42.36 
 
 
245 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  43.35 
 
 
252 aa  174  1e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  42.92 
 
 
252 aa  173  2e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  38.2 
 
 
240 aa  173  3e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.19827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  36.17 
 
 
242 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.35059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  36.68 
 
 
250 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  31.76 
 
 
236 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  33.05 
 
 
243 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  36.96 
 
 
248 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  34.75 
 
 
250 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  33.9 
 
 
251 aa  147  1e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  33.9 
 
 
251 aa  147  1e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  33.9 
 
 
247 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  31.91 
 
 
235 aa  142  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  28.24 
 
 
270 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.63 
 
 
574 aa  92.4  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.5 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  30.87 
 
 
574 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  33.33 
 
 
584 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  30.77 
 
 
614 aa  84  2e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  36.47 
 
 
577 aa  82.8  4e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  32.48 
 
 
576 aa  82.4  6e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  28.38 
 
 
588 aa  82  7e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  30.8 
 
 
543 aa  80.1  3e-14  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  35.33 
 
 
578 aa  80.1  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  36.53 
 
 
578 aa  80.1  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 
560 aa  79.7  4e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  27.07 
 
 
569 aa  79  6e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  29.26 
 
 
578 aa  78.2  1e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.51601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  29.26 
 
 
650 aa  77.8  1e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  26.96 
 
 
580 aa  77.4  2e-13  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  28.14 
 
 
594 aa  76.6  3e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  28.14 
 
 
578 aa  76.6  3e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.11495e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  27.35 
 
 
576 aa  76.3  4e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  31.06 
 
 
642 aa  75.9  5e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  30.34 
 
 
650 aa  75.5  7e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  27.27 
 
 
586 aa  72.8  5e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  24.89 
 
 
573 aa  72.8  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  26.5 
 
 
598 aa  72.4  6e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  26.42 
 
 
571 aa  72  8e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  26.75 
 
 
536 aa  71.6  1e-11  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  28.69 
 
 
334 aa  70.5  2e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  29.71 
 
 
562 aa  70.5  3e-11  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  28.7 
 
 
592 aa  70.1  3e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  69.7  4e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.49 
 
 
245 aa  69.3  5e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.08896e-05  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  24.45 
 
 
557 aa  69.3  6e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  68.9  7e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  28.33 
 
 
334 aa  68.9  7e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  27.03 
 
 
246 aa  68.6  8e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  26.09 
 
 
532 aa  68.6  9e-11  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  26.32 
 
 
584 aa  67.4  2e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.56 
 
 
740 aa  67.4  2e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>