More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2582 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 84 aa  168  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 84 aa  134  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 84 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 92 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 85 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 85 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  74.39 
 
 		 85 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  120  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3611  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000711047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3756  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000137777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3975  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  118  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3359  ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 85 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000421163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 85 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03050  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00726587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0522  ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000023922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4507  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000060246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3481  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3585  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000250774  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3378  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.4045e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03001  hypothetical protein  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0515  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000794781  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3670  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000967389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  70.89 
 
 		 87 aa  116  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 88 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 85 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  71.08 
 
 		 83 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0474  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  116  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000537628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  73.42 
 
 		 87 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  72.62 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 91 aa  115  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3495  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3493  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3662  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0000324123  normal  0.0701159 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3564  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3600  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00592088  normal  0.834432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  71.95 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 91 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 94 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0530  50S ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163692  normal  0.125881 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0958  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000205292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3621  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000351057  normal  0.260967 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.27 
 
 		 87 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  70.73 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0461  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0284  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2549  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000275731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  69.23 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  67.06 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1847  50S ribosomal protein L27  70.51 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 87 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  73.24 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 84 aa  111  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>