More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2581 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  100 
 
 		 356 aa  714    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  62.73 
 
 		 338 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  62.42 
 
 		 338 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.59 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  61.21 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  60.91 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  60.3 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  59.09 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  56.36 
 
 		 338 aa  354  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.01 
 
 		 346 aa  352  4e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.39 
 
 		 425 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  58.56 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  54.86 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  54.86 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  55.84 
 
 		 406 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  54.57 
 
 		 408 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  55.84 
 
 		 406 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  52.69 
 
 		 387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  56.01 
 
 		 337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  54.29 
 
 		 408 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  53.22 
 
 		 407 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  56.21 
 
 		 347 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  52.2 
 
 		 341 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  52.06 
 
 		 341 aa  332  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.99 
 
 		 434 aa  329  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  57.01 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.48 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.18 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  56.23 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  55.32 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  54.3 
 
 		 337 aa  327  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  53.54 
 
 		 422 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  58.77 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  51.27 
 
 		 424 aa  326  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.4 
 
 		 482 aa  325  6e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.56 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  52.26 
 
 		 435 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  54.99 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  51.98 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  55.93 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  53.85 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  54.57 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  51.26 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 427 aa  322  5e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  55.02 
 
 		 427 aa  322  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  51.99 
 
 		 407 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  56.85 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  54.44 
 
 		 405 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  53.58 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  54.41 
 
 		 428 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  56.02 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  55.02 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  54.71 
 
 		 428 aa  318  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.06 
 
 		 463 aa  318  7e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.71 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.84 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  54.66 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  53.25 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  54.84 
 
 		 345 aa  315  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  56.63 
 
 		 348 aa  315  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  53.27 
 
 		 397 aa  315  9e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  56.79 
 
 		 338 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  52.29 
 
 		 358 aa  315  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.14 
 
 		 370 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  50.57 
 
 		 402 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  50.42 
 
 		 349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  49.45 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  54.27 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  52.89 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  52.39 
 
 		 391 aa  311  7.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.91 
 
 		 438 aa  311  9e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  51.51 
 
 		 430 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  49.03 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  55.49 
 
 		 354 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  54.55 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  55.49 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  55.49 
 
 		 354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  53.25 
 
 		 392 aa  309  4e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  53.94 
 
 		 370 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.14 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 		 344 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  49.72 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  49.72 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 		 344 aa  309  5e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  54.14 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  52.29 
 
 		 362 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 372 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  50.29 
 
 		 357 aa  308  8e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  54.85 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>