65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2541 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  31.36 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  31.37 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  33.74 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  34.63 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  31.87 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  29.45 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  36.8 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  52.94 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  28.66 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.69 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.22 
 
 		 220 aa  52.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  36 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  34.52 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  31.11 
 
 		 324 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3297  TonB family protein  26.92 
 
 		 470 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158532  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  28 
 
 		 431 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  33.33 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  30 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  32.1 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.03 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  30.84 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  46.3 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  33.33 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  38.71 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  47.92 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  33.77 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  32.93 
 
 		 268 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2527  TonB family protein  30.38 
 
 		 390 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.700162  normal  0.957554 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  32.93 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.9 
 
 		 411 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  24.52 
 
 		 308 aa  46.2  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  26.76 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  36.36 
 
 		 295 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  26.4 
 
 		 419 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  37.04 
 
 		 230 aa  45.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  32.93 
 
 		 268 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  28.83 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.67 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  34.62 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  29.91 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  25.67 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.31 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  27.1 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  44 
 
 		 233 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  37.31 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  29.55 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  25.51 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  35.19 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  37.5 
 
 		 276 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  36.07 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  25.5 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  36.47 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  40 
 
 		 287 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  26.49 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  40 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0593  TonB-like protein  33.33 
 
 		 267 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  30.11 
 
 		 323 aa  42.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  30.11 
 
 		 323 aa  42.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  43.75 
 
 		 117 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  24.44 
 
 		 219 aa  42.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  40.38 
 
 		 234 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  23.34 
 
 		 297 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>