156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2539 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  62.35 
 
 		 82 aa  100  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  60.24 
 
 		 83 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  62.79 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  61.11 
 
 		 73 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000024131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  53.85 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  48.75 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  57.63 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2720  regulatory protein, FmdB family  60 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  47.19 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  52.38 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1496  regulatory protein, FmdB family  56.1 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000164684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  47.44 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  53.45 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  44.16 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  53.03 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  43.18 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  50.79 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  54.1 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  50.82 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  47.62 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  50.82 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  52.38 
 
 		 63 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  51.32 
 
 		 87 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  47.54 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  46.38 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  45.12 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  45.12 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  45.12 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  45.12 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  50 
 
 		 113 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  41.94 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  50 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  42.22 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  42.17 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  46.3 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  41.33 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0636  hypothetical protein  45.12 
 
 		 83 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108864  normal  0.992354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  45.83 
 
 		 115 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  45.33 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  46.03 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  43.55 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  45 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0572  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.13841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  43.66 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  41.86 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  46.15 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  45.16 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  45.16 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  45.16 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  46.77 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  47.14 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  47.17 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  40.48 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  47.46 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  44.12 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  35.96 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  49.06 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  43.64 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  40.28 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  43.06 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  44.83 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2555  FmdB family regulatory protein  41.18 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0169359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  43.64 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  42.03 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  42.03 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4412  hypothetical protein  42.86 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0167731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  37.8 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  36.67 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  44.44 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  41.27 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000235601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  43.1 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  50.91 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  39.76 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  41.1 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  43.24 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1970  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  36.92 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  42.59 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  36.92 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  42.59 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  31.71 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  40 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  48.28 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000161768 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>